Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCXQ7RTU7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCXQ7RTU7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCXQ7RTU7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCXQ7RTU7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCXQ7RTU7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCXQ7RTU7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCXQ7RTU7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCXQ7RTU7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCXQ7RTU7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCXQ7RTU7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCXQ7RTU7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCXQ7RTU7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCXQ7RTU7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCXQ7RTU7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCXQ7RTU7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCXQ7RTU7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCXQ7RTU7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCXQ7RTU7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCXQ7RTU7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCXQ7RTU7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCXQ7RTU7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCXQ7RTU7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCXQ7RTU7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCXQ7RTU7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCXQ7RTU7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCXQ7RTU7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCXQ7RTU7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCXQ7RTU7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCXQ7RTU7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCXQ7RTU7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCXQ7RTU7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCXQ7RTU7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCXQ7RTU7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCXQ7RTU7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCXQ7RTU7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCXQ7RTU7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCXQ7RTU7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCXQ7RTU7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCXQ7RTU7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCXQ7RTU7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCXQ7RTU7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCXQ7RTU7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCXQ7RTU7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCXQ7RTU7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCXQ7RTU7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCXQ7RTU7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCXQ7RTU7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCXQ7RTU7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCXQ7RTU7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCXQ7RTU7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCXQ7RTU7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCXQ7RTU7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCXQ7RTU7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCXQ7RTU7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCXQ7RTU7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCXQ7RTU7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCXQ7RTU7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCXQ7RTU7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCXQ7RTU7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCXQ7RTU7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCXQ7RTU7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCXQ7RTU7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCXQ7RTU7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCXQ7RTU7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCXQ7RTU7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCXQ7RTU7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCXQ7RTU7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCXQ7RTU7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCXQ7RTU7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCXQ7RTU7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCXQ7RTU7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCXQ7RTU7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCXQ7RTU7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SCXQ7RTU7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCXQ7RTU7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCXQ7RTU7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCXQ7RTU7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCXQ7RTU7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCXQ7RTU7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms