Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED13LQ71F56 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED13LQ71F56 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED13LQ71F56 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MED13LQ71F56 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED13LQ71F56 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED13LQ71F56 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED13LQ71F56 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED13LQ71F56 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MED13LQ71F56 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED13LQ71F56 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED13LQ71F56 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED13LQ71F56 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED13LQ71F56 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED13LQ71F56 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED13LQ71F56 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED13LQ71F56 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED13LQ71F56 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED13LQ71F56 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED13LQ71F56 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED13LQ71F56 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED13LQ71F56 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MED13LQ71F56 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED13LQ71F56 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED13LQ71F56 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED13LQ71F56 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED13LQ71F56 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED13LQ71F56 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED13LQ71F56 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED13LQ71F56 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED13LQ71F56 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED13LQ71F56 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED13LQ71F56 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED13LQ71F56 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MED13LQ71F56 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED13LQ71F56 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED13LQ71F56 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MED13LQ71F56 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED13LQ71F56 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED13LQ71F56 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED13LQ71F56 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MED13LQ71F56 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED13LQ71F56 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED13LQ71F56 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MED13LQ71F56 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED13LQ71F56 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED13LQ71F56 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED13LQ71F56 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED13LQ71F56 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED13LQ71F56 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED13LQ71F56 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED13LQ71F56 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED13LQ71F56 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED13LQ71F56 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED13LQ71F56 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED13LQ71F56 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED13LQ71F56 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED13LQ71F56 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED13LQ71F56 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED13LQ71F56 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED13LQ71F56 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED13LQ71F56 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MED13LQ71F56 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MED13LQ71F56 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED13LQ71F56 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED13LQ71F56 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED13LQ71F56 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MED13LQ71F56 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MED13LQ71F56 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED13LQ71F56 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED13LQ71F56 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED13LQ71F56 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED13LQ71F56 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED13LQ71F56 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED13LQ71F56 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED13LQ71F56 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED13LQ71F56 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED13LQ71F56 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED13LQ71F56 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED13LQ71F56 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED13LQ71F56 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MED13LQ71F56 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED13LQ71F56 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED13LQ71F56 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED13LQ71F56 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED13LQ71F56 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED13LQ71F56 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED13LQ71F56 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED13LQ71F56 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED13LQ71F56 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MED13LQ71F56 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED13LQ71F56 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED13LQ71F56 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED13LQ71F56 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED13LQ71F56 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED13LQ71F56 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED13LQ71F56 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED13LQ71F56 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED13LQ71F56 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED13LQ71F56 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms