Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW05

PTCHD4, Patched domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCHD4Q6ZW05 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCHD4Q6ZW05 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCHD4Q6ZW05 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCHD4Q6ZW05 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTCHD4Q6ZW05 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTCHD4Q6ZW05 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCHD4Q6ZW05 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCHD4Q6ZW05 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCHD4Q6ZW05 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCHD4Q6ZW05 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCHD4Q6ZW05 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCHD4Q6ZW05 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTCHD4Q6ZW05 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTCHD4Q6ZW05 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCHD4Q6ZW05 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTCHD4Q6ZW05 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCHD4Q6ZW05 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCHD4Q6ZW05 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCHD4Q6ZW05 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCHD4Q6ZW05 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTCHD4Q6ZW05 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCHD4Q6ZW05 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTCHD4Q6ZW05 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCHD4Q6ZW05 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCHD4Q6ZW05 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCHD4Q6ZW05 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCHD4Q6ZW05 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCHD4Q6ZW05 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTCHD4Q6ZW05 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCHD4Q6ZW05 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTCHD4Q6ZW05 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTCHD4Q6ZW05 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTCHD4Q6ZW05 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCHD4Q6ZW05 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTCHD4Q6ZW05 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCHD4Q6ZW05 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTCHD4Q6ZW05 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCHD4Q6ZW05 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCHD4Q6ZW05 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCHD4Q6ZW05 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCHD4Q6ZW05 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCHD4Q6ZW05 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTCHD4Q6ZW05 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTCHD4Q6ZW05 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCHD4Q6ZW05 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCHD4Q6ZW05 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCHD4Q6ZW05 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCHD4Q6ZW05 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTCHD4Q6ZW05 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTCHD4Q6ZW05 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCHD4Q6ZW05 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCHD4Q6ZW05 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTCHD4Q6ZW05 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCHD4Q6ZW05 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCHD4Q6ZW05 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCHD4Q6ZW05 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCHD4Q6ZW05 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCHD4Q6ZW05 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCHD4Q6ZW05 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCHD4Q6ZW05 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCHD4Q6ZW05 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCHD4Q6ZW05 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCHD4Q6ZW05 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCHD4Q6ZW05 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCHD4Q6ZW05 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTCHD4Q6ZW05 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCHD4Q6ZW05 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCHD4Q6ZW05 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCHD4Q6ZW05 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCHD4Q6ZW05 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCHD4Q6ZW05 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCHD4Q6ZW05 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCHD4Q6ZW05 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCHD4Q6ZW05 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCHD4Q6ZW05 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCHD4Q6ZW05 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCHD4Q6ZW05 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCHD4Q6ZW05 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTCHD4Q6ZW05 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTCHD4Q6ZW05 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTCHD4Q6ZW05 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCHD4Q6ZW05 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCHD4Q6ZW05 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms