Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
UBR3Q6ZT12 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
UBR3Q6ZT12 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
UBR3Q6ZT12 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
UBR3Q6ZT12 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
UBR3Q6ZT12 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
UBR3Q6ZT12 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
UBR3Q6ZT12 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
UBR3Q6ZT12 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
UBR3Q6ZT12 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
UBR3Q6ZT12 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
UBR3Q6ZT12 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
UBR3Q6ZT12 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
UBR3Q6ZT12 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
UBR3Q6ZT12 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
UBR3Q6ZT12 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
UBR3Q6ZT12 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
UBR3Q6ZT12 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
UBR3Q6ZT12 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
UBR3Q6ZT12 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
UBR3Q6ZT12 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
UBR3Q6ZT12 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
UBR3Q6ZT12 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
UBR3Q6ZT12 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
UBR3Q6ZT12 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
UBR3Q6ZT12 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
UBR3Q6ZT12 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
UBR3Q6ZT12 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
UBR3Q6ZT12 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
UBR3Q6ZT12 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
UBR3Q6ZT12 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
UBR3Q6ZT12 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
UBR3Q6ZT12 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
UBR3Q6ZT12 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
UBR3Q6ZT12 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
UBR3Q6ZT12 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
UBR3Q6ZT12 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
UBR3Q6ZT12 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
UBR3Q6ZT12 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
UBR3Q6ZT12 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
UBR3Q6ZT12 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
UBR3Q6ZT12 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
UBR3Q6ZT12 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
UBR3Q6ZT12 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
UBR3Q6ZT12 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
UBR3Q6ZT12 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
UBR3Q6ZT12 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
UBR3Q6ZT12 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
UBR3Q6ZT12 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
UBR3Q6ZT12 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
UBR3Q6ZT12 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
UBR3Q6ZT12 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
UBR3Q6ZT12 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
UBR3Q6ZT12 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
UBR3Q6ZT12 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
UBR3Q6ZT12 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
UBR3Q6ZT12 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
UBR3Q6ZT12 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
UBR3Q6ZT12 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
UBR3Q6ZT12 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
UBR3Q6ZT12 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
UBR3Q6ZT12 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
UBR3Q6ZT12 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
UBR3Q6ZT12 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
UBR3Q6ZT12 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
UBR3Q6ZT12 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
UBR3Q6ZT12 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
UBR3Q6ZT12 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
UBR3Q6ZT12 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
UBR3Q6ZT12 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
UBR3Q6ZT12 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
UBR3Q6ZT12 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
UBR3Q6ZT12 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
UBR3Q6ZT12 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
UBR3Q6ZT12 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
UBR3Q6ZT12 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
UBR3Q6ZT12 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
UBR3Q6ZT12 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
UBR3Q6ZT12 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
UBR3Q6ZT12 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
UBR3Q6ZT12 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
UBR3Q6ZT12 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
UBR3Q6ZT12 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
UBR3Q6ZT12 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
UBR3Q6ZT12 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
UBR3Q6ZT12 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
UBR3Q6ZT12 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
UBR3Q6ZT12 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
UBR3Q6ZT12 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
UBR3Q6ZT12 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
UBR3Q6ZT12 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
UBR3Q6ZT12 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
UBR3Q6ZT12 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
UBR3Q6ZT12 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
UBR3Q6ZT12 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
UBR3Q6ZT12 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
UBR3Q6ZT12 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
UBR3Q6ZT12 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
UBR3Q6ZT12 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
UBR3Q6ZT12 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms