Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRP0

PRR23C, Proline-rich protein 23C, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23CQ6ZRP0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRR23CQ6ZRP0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRR23CQ6ZRP0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRR23CQ6ZRP0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRR23CQ6ZRP0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRR23CQ6ZRP0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRR23CQ6ZRP0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRR23CQ6ZRP0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRR23CQ6ZRP0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRR23CQ6ZRP0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRR23CQ6ZRP0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRR23CQ6ZRP0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRR23CQ6ZRP0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRR23CQ6ZRP0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRR23CQ6ZRP0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRR23CQ6ZRP0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRR23CQ6ZRP0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRR23CQ6ZRP0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRR23CQ6ZRP0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRR23CQ6ZRP0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRR23CQ6ZRP0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRR23CQ6ZRP0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRR23CQ6ZRP0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRR23CQ6ZRP0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRR23CQ6ZRP0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRR23CQ6ZRP0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRR23CQ6ZRP0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRR23CQ6ZRP0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRR23CQ6ZRP0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRR23CQ6ZRP0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRR23CQ6ZRP0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRR23CQ6ZRP0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRR23CQ6ZRP0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRR23CQ6ZRP0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PRR23CQ6ZRP0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRR23CQ6ZRP0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRR23CQ6ZRP0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRR23CQ6ZRP0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRR23CQ6ZRP0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRR23CQ6ZRP0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PRR23CQ6ZRP0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PRR23CQ6ZRP0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRR23CQ6ZRP0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRR23CQ6ZRP0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRR23CQ6ZRP0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRR23CQ6ZRP0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRR23CQ6ZRP0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRR23CQ6ZRP0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRR23CQ6ZRP0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRR23CQ6ZRP0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRR23CQ6ZRP0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRR23CQ6ZRP0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRR23CQ6ZRP0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRR23CQ6ZRP0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRR23CQ6ZRP0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRR23CQ6ZRP0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRR23CQ6ZRP0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRR23CQ6ZRP0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRR23CQ6ZRP0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRR23CQ6ZRP0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRR23CQ6ZRP0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PRR23CQ6ZRP0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRR23CQ6ZRP0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRR23CQ6ZRP0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRR23CQ6ZRP0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRR23CQ6ZRP0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRR23CQ6ZRP0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRR23CQ6ZRP0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRR23CQ6ZRP0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRR23CQ6ZRP0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRR23CQ6ZRP0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRR23CQ6ZRP0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRR23CQ6ZRP0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRR23CQ6ZRP0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRR23CQ6ZRP0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRR23CQ6ZRP0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRR23CQ6ZRP0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRR23CQ6ZRP0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRR23CQ6ZRP0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRR23CQ6ZRP0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRR23CQ6ZRP0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRR23CQ6ZRP0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRR23CQ6ZRP0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRR23CQ6ZRP0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRR23CQ6ZRP0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRR23CQ6ZRP0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRR23CQ6ZRP0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRR23CQ6ZRP0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRR23CQ6ZRP0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRR23CQ6ZRP0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRR23CQ6ZRP0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRR23CQ6ZRP0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRR23CQ6ZRP0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRR23CQ6ZRP0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRR23CQ6ZRP0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRR23CQ6ZRP0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRR23CQ6ZRP0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR23CQ6ZRP0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR23CQ6ZRP0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR23CQ6ZRP0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms