Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP01

RBM44, RNA-binding protein 44, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM44Q6ZP01 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM44Q6ZP01 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM44Q6ZP01 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM44Q6ZP01 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM44Q6ZP01 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM44Q6ZP01 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM44Q6ZP01 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM44Q6ZP01 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM44Q6ZP01 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM44Q6ZP01 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM44Q6ZP01 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM44Q6ZP01 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM44Q6ZP01 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM44Q6ZP01 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM44Q6ZP01 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM44Q6ZP01 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM44Q6ZP01 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM44Q6ZP01 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM44Q6ZP01 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM44Q6ZP01 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RBM44Q6ZP01 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM44Q6ZP01 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RBM44Q6ZP01 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBM44Q6ZP01 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM44Q6ZP01 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM44Q6ZP01 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM44Q6ZP01 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM44Q6ZP01 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM44Q6ZP01 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM44Q6ZP01 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM44Q6ZP01 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM44Q6ZP01 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM44Q6ZP01 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM44Q6ZP01 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM44Q6ZP01 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM44Q6ZP01 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM44Q6ZP01 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM44Q6ZP01 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM44Q6ZP01 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM44Q6ZP01 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM44Q6ZP01 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM44Q6ZP01 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM44Q6ZP01 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM44Q6ZP01 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM44Q6ZP01 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM44Q6ZP01 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM44Q6ZP01 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM44Q6ZP01 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM44Q6ZP01 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM44Q6ZP01 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM44Q6ZP01 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM44Q6ZP01 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM44Q6ZP01 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM44Q6ZP01 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM44Q6ZP01 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM44Q6ZP01 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM44Q6ZP01 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM44Q6ZP01 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM44Q6ZP01 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM44Q6ZP01 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM44Q6ZP01 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM44Q6ZP01 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM44Q6ZP01 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM44Q6ZP01 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM44Q6ZP01 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM44Q6ZP01 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM44Q6ZP01 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM44Q6ZP01 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM44Q6ZP01 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RBM44Q6ZP01 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RBM44Q6ZP01 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM44Q6ZP01 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM44Q6ZP01 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM44Q6ZP01 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM44Q6ZP01 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM44Q6ZP01 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM44Q6ZP01 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM44Q6ZP01 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM44Q6ZP01 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM44Q6ZP01 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM44Q6ZP01 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM44Q6ZP01 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM44Q6ZP01 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM44Q6ZP01 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM44Q6ZP01 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM44Q6ZP01 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM44Q6ZP01 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM44Q6ZP01 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM44Q6ZP01 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM44Q6ZP01 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM44Q6ZP01 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM44Q6ZP01 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM44Q6ZP01 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM44Q6ZP01 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM44Q6ZP01 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM44Q6ZP01 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM44Q6ZP01 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM44Q6ZP01 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM44Q6ZP01 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM44Q6ZP01 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms