Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRN1Q6UXK5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRN1Q6UXK5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRN1Q6UXK5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRN1Q6UXK5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRN1Q6UXK5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRN1Q6UXK5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRN1Q6UXK5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRN1Q6UXK5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRN1Q6UXK5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRN1Q6UXK5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRN1Q6UXK5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRN1Q6UXK5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRN1Q6UXK5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRN1Q6UXK5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRN1Q6UXK5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRN1Q6UXK5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRN1Q6UXK5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRN1Q6UXK5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRN1Q6UXK5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRN1Q6UXK5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRN1Q6UXK5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRN1Q6UXK5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRN1Q6UXK5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRN1Q6UXK5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRN1Q6UXK5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRN1Q6UXK5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRN1Q6UXK5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRN1Q6UXK5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRN1Q6UXK5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRN1Q6UXK5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRN1Q6UXK5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRN1Q6UXK5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRN1Q6UXK5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRN1Q6UXK5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRN1Q6UXK5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRN1Q6UXK5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRN1Q6UXK5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRN1Q6UXK5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRN1Q6UXK5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRN1Q6UXK5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRN1Q6UXK5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRN1Q6UXK5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRN1Q6UXK5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRN1Q6UXK5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRN1Q6UXK5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRN1Q6UXK5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRN1Q6UXK5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRN1Q6UXK5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRN1Q6UXK5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRN1Q6UXK5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRN1Q6UXK5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRN1Q6UXK5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN1Q6UXK5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN1Q6UXK5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN1Q6UXK5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRN1Q6UXK5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRN1Q6UXK5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRN1Q6UXK5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRN1Q6UXK5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN1Q6UXK5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN1Q6UXK5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN1Q6UXK5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN1Q6UXK5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRN1Q6UXK5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN1Q6UXK5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRN1Q6UXK5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN1Q6UXK5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN1Q6UXK5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN1Q6UXK5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN1Q6UXK5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN1Q6UXK5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN1Q6UXK5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRN1Q6UXK5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRN1Q6UXK5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRN1Q6UXK5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRN1Q6UXK5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRN1Q6UXK5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRN1Q6UXK5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRN1Q6UXK5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN1Q6UXK5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN1Q6UXK5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN1Q6UXK5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN1Q6UXK5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN1Q6UXK5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN1Q6UXK5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRN1Q6UXK5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRN1Q6UXK5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRN1Q6UXK5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN1Q6UXK5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN1Q6UXK5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRN1Q6UXK5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRN1Q6UXK5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRN1Q6UXK5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRN1Q6UXK5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN1Q6UXK5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRN1Q6UXK5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRN1Q6UXK5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN1Q6UXK5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN1Q6UXK5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms