Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ATAD2Q6PL18 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ATAD2Q6PL18 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ATAD2Q6PL18 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ATAD2Q6PL18 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
ATAD2Q6PL18 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ATAD2Q6PL18 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ATAD2Q6PL18 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ATAD2Q6PL18 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ATAD2Q6PL18 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ATAD2Q6PL18 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ATAD2Q6PL18 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ATAD2Q6PL18 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.95■■■■□ 3.83
ATAD2Q6PL18 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ATAD2Q6PL18 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
ATAD2Q6PL18 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
ATAD2Q6PL18 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ATAD2Q6PL18 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.82
ATAD2Q6PL18 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
ATAD2Q6PL18 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
ATAD2Q6PL18 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
ATAD2Q6PL18 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
ATAD2Q6PL18 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
ATAD2Q6PL18 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
ATAD2Q6PL18 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
ATAD2Q6PL18 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
ATAD2Q6PL18 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
ATAD2Q6PL18 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ATAD2Q6PL18 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ATAD2Q6PL18 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
ATAD2Q6PL18 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ATAD2Q6PL18 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ATAD2Q6PL18 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ATAD2Q6PL18 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ATAD2Q6PL18 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ATAD2Q6PL18 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ATAD2Q6PL18 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
ATAD2Q6PL18 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
ATAD2Q6PL18 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ATAD2Q6PL18 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ATAD2Q6PL18 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
ATAD2Q6PL18 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ATAD2Q6PL18 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ATAD2Q6PL18 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
ATAD2Q6PL18 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ATAD2Q6PL18 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ATAD2Q6PL18 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ATAD2Q6PL18 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ATAD2Q6PL18 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
ATAD2Q6PL18 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ATAD2Q6PL18 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
ATAD2Q6PL18 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ATAD2Q6PL18 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ATAD2Q6PL18 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
ATAD2Q6PL18 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ATAD2Q6PL18 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ATAD2Q6PL18 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ATAD2Q6PL18 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ATAD2Q6PL18 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ATAD2Q6PL18 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ATAD2Q6PL18 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ATAD2Q6PL18 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ATAD2Q6PL18 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ATAD2Q6PL18 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ATAD2Q6PL18 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
ATAD2Q6PL18 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ATAD2Q6PL18 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ATAD2Q6PL18 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ATAD2Q6PL18 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ATAD2Q6PL18 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ATAD2Q6PL18 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
ATAD2Q6PL18 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATAD2Q6PL18 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ATAD2Q6PL18 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ATAD2Q6PL18 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ATAD2Q6PL18 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
ATAD2Q6PL18 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ATAD2Q6PL18 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ATAD2Q6PL18 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ATAD2Q6PL18 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ATAD2Q6PL18 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ATAD2Q6PL18 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ATAD2Q6PL18 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ATAD2Q6PL18 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ATAD2Q6PL18 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ATAD2Q6PL18 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ATAD2Q6PL18 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATAD2Q6PL18 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATAD2Q6PL18 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATAD2Q6PL18 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ATAD2Q6PL18 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.7
ATAD2Q6PL18 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ATAD2Q6PL18 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
ATAD2Q6PL18 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ATAD2Q6PL18 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ATAD2Q6PL18 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ATAD2Q6PL18 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ATAD2Q6PL18 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ATAD2Q6PL18 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
ATAD2Q6PL18 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms