Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBA3EQ6PEY2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBA3EQ6PEY2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBA3EQ6PEY2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBA3EQ6PEY2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBA3EQ6PEY2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBA3EQ6PEY2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBA3EQ6PEY2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBA3EQ6PEY2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBA3EQ6PEY2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBA3EQ6PEY2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBA3EQ6PEY2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBA3EQ6PEY2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBA3EQ6PEY2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBA3EQ6PEY2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBA3EQ6PEY2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBA3EQ6PEY2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBA3EQ6PEY2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBA3EQ6PEY2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBA3EQ6PEY2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBA3EQ6PEY2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBA3EQ6PEY2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBA3EQ6PEY2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBA3EQ6PEY2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBA3EQ6PEY2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBA3EQ6PEY2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBA3EQ6PEY2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBA3EQ6PEY2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBA3EQ6PEY2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBA3EQ6PEY2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TUBA3EQ6PEY2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBA3EQ6PEY2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBA3EQ6PEY2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBA3EQ6PEY2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBA3EQ6PEY2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBA3EQ6PEY2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBA3EQ6PEY2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBA3EQ6PEY2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBA3EQ6PEY2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBA3EQ6PEY2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBA3EQ6PEY2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBA3EQ6PEY2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBA3EQ6PEY2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBA3EQ6PEY2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBA3EQ6PEY2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBA3EQ6PEY2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBA3EQ6PEY2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBA3EQ6PEY2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBA3EQ6PEY2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBA3EQ6PEY2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBA3EQ6PEY2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBA3EQ6PEY2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBA3EQ6PEY2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBA3EQ6PEY2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBA3EQ6PEY2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBA3EQ6PEY2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBA3EQ6PEY2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBA3EQ6PEY2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBA3EQ6PEY2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBA3EQ6PEY2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBA3EQ6PEY2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBA3EQ6PEY2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBA3EQ6PEY2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBA3EQ6PEY2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBA3EQ6PEY2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBA3EQ6PEY2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBA3EQ6PEY2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA3EQ6PEY2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA3EQ6PEY2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA3EQ6PEY2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA3EQ6PEY2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA3EQ6PEY2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA3EQ6PEY2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBA3EQ6PEY2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBA3EQ6PEY2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBA3EQ6PEY2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBA3EQ6PEY2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBA3EQ6PEY2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBA3EQ6PEY2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBA3EQ6PEY2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBA3EQ6PEY2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms