Protein–RNA interactions for Protein: Q6P461

ACSM6, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM6Q6P461 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM6Q6P461 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM6Q6P461 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM6Q6P461 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms