Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRPF40BQ6NWY9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRPF40BQ6NWY9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
PRPF40BQ6NWY9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRPF40BQ6NWY9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRPF40BQ6NWY9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRPF40BQ6NWY9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PRPF40BQ6NWY9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PRPF40BQ6NWY9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PRPF40BQ6NWY9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PRPF40BQ6NWY9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRPF40BQ6NWY9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PRPF40BQ6NWY9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRPF40BQ6NWY9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRPF40BQ6NWY9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRPF40BQ6NWY9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRPF40BQ6NWY9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRPF40BQ6NWY9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRPF40BQ6NWY9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
PRPF40BQ6NWY9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRPF40BQ6NWY9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRPF40BQ6NWY9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRPF40BQ6NWY9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRPF40BQ6NWY9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRPF40BQ6NWY9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
PRPF40BQ6NWY9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRPF40BQ6NWY9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PRPF40BQ6NWY9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRPF40BQ6NWY9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRPF40BQ6NWY9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRPF40BQ6NWY9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PRPF40BQ6NWY9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PRPF40BQ6NWY9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRPF40BQ6NWY9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRPF40BQ6NWY9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRPF40BQ6NWY9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRPF40BQ6NWY9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRPF40BQ6NWY9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRPF40BQ6NWY9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRPF40BQ6NWY9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRPF40BQ6NWY9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PRPF40BQ6NWY9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
PRPF40BQ6NWY9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
PRPF40BQ6NWY9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PRPF40BQ6NWY9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRPF40BQ6NWY9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRPF40BQ6NWY9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRPF40BQ6NWY9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
PRPF40BQ6NWY9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRPF40BQ6NWY9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PRPF40BQ6NWY9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PRPF40BQ6NWY9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
PRPF40BQ6NWY9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRPF40BQ6NWY9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRPF40BQ6NWY9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRPF40BQ6NWY9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRPF40BQ6NWY9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRPF40BQ6NWY9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRPF40BQ6NWY9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRPF40BQ6NWY9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRPF40BQ6NWY9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRPF40BQ6NWY9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRPF40BQ6NWY9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRPF40BQ6NWY9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRPF40BQ6NWY9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PRPF40BQ6NWY9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRPF40BQ6NWY9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRPF40BQ6NWY9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRPF40BQ6NWY9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
PRPF40BQ6NWY9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRPF40BQ6NWY9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PRPF40BQ6NWY9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRPF40BQ6NWY9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRPF40BQ6NWY9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRPF40BQ6NWY9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRPF40BQ6NWY9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRPF40BQ6NWY9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PRPF40BQ6NWY9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRPF40BQ6NWY9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRPF40BQ6NWY9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRPF40BQ6NWY9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRPF40BQ6NWY9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRPF40BQ6NWY9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRPF40BQ6NWY9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRPF40BQ6NWY9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRPF40BQ6NWY9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRPF40BQ6NWY9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRPF40BQ6NWY9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRPF40BQ6NWY9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRPF40BQ6NWY9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRPF40BQ6NWY9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRPF40BQ6NWY9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRPF40BQ6NWY9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRPF40BQ6NWY9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRPF40BQ6NWY9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRPF40BQ6NWY9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms