Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RCSD1Q6JBY9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RCSD1Q6JBY9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RCSD1Q6JBY9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RCSD1Q6JBY9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RCSD1Q6JBY9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RCSD1Q6JBY9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
RCSD1Q6JBY9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RCSD1Q6JBY9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RCSD1Q6JBY9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RCSD1Q6JBY9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
RCSD1Q6JBY9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RCSD1Q6JBY9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RCSD1Q6JBY9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RCSD1Q6JBY9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RCSD1Q6JBY9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RCSD1Q6JBY9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RCSD1Q6JBY9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RCSD1Q6JBY9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
RCSD1Q6JBY9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RCSD1Q6JBY9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RCSD1Q6JBY9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RCSD1Q6JBY9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RCSD1Q6JBY9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RCSD1Q6JBY9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RCSD1Q6JBY9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RCSD1Q6JBY9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
RCSD1Q6JBY9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RCSD1Q6JBY9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RCSD1Q6JBY9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RCSD1Q6JBY9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RCSD1Q6JBY9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RCSD1Q6JBY9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
RCSD1Q6JBY9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RCSD1Q6JBY9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RCSD1Q6JBY9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RCSD1Q6JBY9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RCSD1Q6JBY9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RCSD1Q6JBY9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RCSD1Q6JBY9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RCSD1Q6JBY9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RCSD1Q6JBY9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RCSD1Q6JBY9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RCSD1Q6JBY9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RCSD1Q6JBY9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RCSD1Q6JBY9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RCSD1Q6JBY9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RCSD1Q6JBY9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RCSD1Q6JBY9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RCSD1Q6JBY9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RCSD1Q6JBY9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RCSD1Q6JBY9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RCSD1Q6JBY9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
RCSD1Q6JBY9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RCSD1Q6JBY9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RCSD1Q6JBY9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RCSD1Q6JBY9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RCSD1Q6JBY9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
RCSD1Q6JBY9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RCSD1Q6JBY9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RCSD1Q6JBY9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RCSD1Q6JBY9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RCSD1Q6JBY9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RCSD1Q6JBY9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RCSD1Q6JBY9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RCSD1Q6JBY9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RCSD1Q6JBY9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RCSD1Q6JBY9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RCSD1Q6JBY9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RCSD1Q6JBY9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RCSD1Q6JBY9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RCSD1Q6JBY9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RCSD1Q6JBY9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RCSD1Q6JBY9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RCSD1Q6JBY9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RCSD1Q6JBY9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RCSD1Q6JBY9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RCSD1Q6JBY9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RCSD1Q6JBY9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RCSD1Q6JBY9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RCSD1Q6JBY9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RCSD1Q6JBY9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RCSD1Q6JBY9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RCSD1Q6JBY9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RCSD1Q6JBY9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RCSD1Q6JBY9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RCSD1Q6JBY9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RCSD1Q6JBY9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RCSD1Q6JBY9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RCSD1Q6JBY9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RCSD1Q6JBY9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RCSD1Q6JBY9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RCSD1Q6JBY9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RCSD1Q6JBY9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RCSD1Q6JBY9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RCSD1Q6JBY9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RCSD1Q6JBY9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RCSD1Q6JBY9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RCSD1Q6JBY9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RCSD1Q6JBY9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms