Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPRIN2Q6IMN6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPRIN2Q6IMN6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPRIN2Q6IMN6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPRIN2Q6IMN6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPRIN2Q6IMN6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPRIN2Q6IMN6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPRIN2Q6IMN6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPRIN2Q6IMN6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPRIN2Q6IMN6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CAPRIN2Q6IMN6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPRIN2Q6IMN6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CAPRIN2Q6IMN6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CAPRIN2Q6IMN6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CAPRIN2Q6IMN6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CAPRIN2Q6IMN6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CAPRIN2Q6IMN6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPRIN2Q6IMN6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPRIN2Q6IMN6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPRIN2Q6IMN6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPRIN2Q6IMN6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPRIN2Q6IMN6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPRIN2Q6IMN6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPRIN2Q6IMN6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPRIN2Q6IMN6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPRIN2Q6IMN6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPRIN2Q6IMN6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPRIN2Q6IMN6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPRIN2Q6IMN6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPRIN2Q6IMN6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPRIN2Q6IMN6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPRIN2Q6IMN6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPRIN2Q6IMN6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPRIN2Q6IMN6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPRIN2Q6IMN6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPRIN2Q6IMN6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPRIN2Q6IMN6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPRIN2Q6IMN6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPRIN2Q6IMN6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPRIN2Q6IMN6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPRIN2Q6IMN6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPRIN2Q6IMN6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPRIN2Q6IMN6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAPRIN2Q6IMN6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPRIN2Q6IMN6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPRIN2Q6IMN6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPRIN2Q6IMN6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPRIN2Q6IMN6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPRIN2Q6IMN6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPRIN2Q6IMN6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPRIN2Q6IMN6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPRIN2Q6IMN6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPRIN2Q6IMN6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CAPRIN2Q6IMN6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPRIN2Q6IMN6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPRIN2Q6IMN6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPRIN2Q6IMN6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPRIN2Q6IMN6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPRIN2Q6IMN6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPRIN2Q6IMN6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPRIN2Q6IMN6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPRIN2Q6IMN6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPRIN2Q6IMN6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPRIN2Q6IMN6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPRIN2Q6IMN6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPRIN2Q6IMN6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPRIN2Q6IMN6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPRIN2Q6IMN6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPRIN2Q6IMN6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPRIN2Q6IMN6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPRIN2Q6IMN6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPRIN2Q6IMN6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPRIN2Q6IMN6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPRIN2Q6IMN6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPRIN2Q6IMN6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPRIN2Q6IMN6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPRIN2Q6IMN6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPRIN2Q6IMN6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPRIN2Q6IMN6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPRIN2Q6IMN6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPRIN2Q6IMN6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPRIN2Q6IMN6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPRIN2Q6IMN6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPRIN2Q6IMN6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPRIN2Q6IMN6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPRIN2Q6IMN6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPRIN2Q6IMN6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPRIN2Q6IMN6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPRIN2Q6IMN6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPRIN2Q6IMN6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPRIN2Q6IMN6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPRIN2Q6IMN6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPRIN2Q6IMN6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPRIN2Q6IMN6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPRIN2Q6IMN6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms