Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ANKRD40Q6AI12 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ANKRD40Q6AI12 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ANKRD40Q6AI12 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ANKRD40Q6AI12 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ANKRD40Q6AI12 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ANKRD40Q6AI12 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
ANKRD40Q6AI12 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ANKRD40Q6AI12 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ANKRD40Q6AI12 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ANKRD40Q6AI12 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ANKRD40Q6AI12 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ANKRD40Q6AI12 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ANKRD40Q6AI12 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ANKRD40Q6AI12 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ANKRD40Q6AI12 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ANKRD40Q6AI12 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ANKRD40Q6AI12 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ANKRD40Q6AI12 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
ANKRD40Q6AI12 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ANKRD40Q6AI12 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ANKRD40Q6AI12 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ANKRD40Q6AI12 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ANKRD40Q6AI12 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ANKRD40Q6AI12 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ANKRD40Q6AI12 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ANKRD40Q6AI12 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ANKRD40Q6AI12 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ANKRD40Q6AI12 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ANKRD40Q6AI12 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ANKRD40Q6AI12 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ANKRD40Q6AI12 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ANKRD40Q6AI12 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ANKRD40Q6AI12 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ANKRD40Q6AI12 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ANKRD40Q6AI12 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ANKRD40Q6AI12 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ANKRD40Q6AI12 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ANKRD40Q6AI12 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ANKRD40Q6AI12 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ANKRD40Q6AI12 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ANKRD40Q6AI12 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ANKRD40Q6AI12 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ANKRD40Q6AI12 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ANKRD40Q6AI12 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ANKRD40Q6AI12 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ANKRD40Q6AI12 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ANKRD40Q6AI12 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ANKRD40Q6AI12 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ANKRD40Q6AI12 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ANKRD40Q6AI12 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ANKRD40Q6AI12 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ANKRD40Q6AI12 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ANKRD40Q6AI12 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ANKRD40Q6AI12 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ANKRD40Q6AI12 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ANKRD40Q6AI12 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ANKRD40Q6AI12 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ANKRD40Q6AI12 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ANKRD40Q6AI12 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ANKRD40Q6AI12 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ANKRD40Q6AI12 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ANKRD40Q6AI12 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ANKRD40Q6AI12 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ANKRD40Q6AI12 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ANKRD40Q6AI12 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ANKRD40Q6AI12 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ANKRD40Q6AI12 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ANKRD40Q6AI12 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ANKRD40Q6AI12 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ANKRD40Q6AI12 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ANKRD40Q6AI12 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ANKRD40Q6AI12 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ANKRD40Q6AI12 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ANKRD40Q6AI12 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ANKRD40Q6AI12 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ANKRD40Q6AI12 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ANKRD40Q6AI12 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ANKRD40Q6AI12 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ANKRD40Q6AI12 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ANKRD40Q6AI12 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ANKRD40Q6AI12 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ANKRD40Q6AI12 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ANKRD40Q6AI12 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ANKRD40Q6AI12 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ANKRD40Q6AI12 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ANKRD40Q6AI12 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ANKRD40Q6AI12 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ANKRD40Q6AI12 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ANKRD40Q6AI12 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ANKRD40Q6AI12 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ANKRD40Q6AI12 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ANKRD40Q6AI12 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ANKRD40Q6AI12 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ANKRD40Q6AI12 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ANKRD40Q6AI12 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ANKRD40Q6AI12 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ANKRD40Q6AI12 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ANKRD40Q6AI12 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms