Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RNF123Q5XPI4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RNF123Q5XPI4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RNF123Q5XPI4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RNF123Q5XPI4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RNF123Q5XPI4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RNF123Q5XPI4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RNF123Q5XPI4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RNF123Q5XPI4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
RNF123Q5XPI4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RNF123Q5XPI4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RNF123Q5XPI4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RNF123Q5XPI4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RNF123Q5XPI4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RNF123Q5XPI4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RNF123Q5XPI4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RNF123Q5XPI4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RNF123Q5XPI4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RNF123Q5XPI4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RNF123Q5XPI4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RNF123Q5XPI4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RNF123Q5XPI4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RNF123Q5XPI4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RNF123Q5XPI4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RNF123Q5XPI4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RNF123Q5XPI4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RNF123Q5XPI4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RNF123Q5XPI4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RNF123Q5XPI4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RNF123Q5XPI4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RNF123Q5XPI4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RNF123Q5XPI4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RNF123Q5XPI4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RNF123Q5XPI4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RNF123Q5XPI4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RNF123Q5XPI4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RNF123Q5XPI4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RNF123Q5XPI4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RNF123Q5XPI4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RNF123Q5XPI4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RNF123Q5XPI4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RNF123Q5XPI4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RNF123Q5XPI4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RNF123Q5XPI4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RNF123Q5XPI4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RNF123Q5XPI4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RNF123Q5XPI4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RNF123Q5XPI4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RNF123Q5XPI4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RNF123Q5XPI4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RNF123Q5XPI4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RNF123Q5XPI4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RNF123Q5XPI4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RNF123Q5XPI4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
RNF123Q5XPI4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
RNF123Q5XPI4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RNF123Q5XPI4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RNF123Q5XPI4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RNF123Q5XPI4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RNF123Q5XPI4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RNF123Q5XPI4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
RNF123Q5XPI4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
RNF123Q5XPI4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RNF123Q5XPI4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RNF123Q5XPI4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RNF123Q5XPI4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
RNF123Q5XPI4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RNF123Q5XPI4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RNF123Q5XPI4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RNF123Q5XPI4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RNF123Q5XPI4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RNF123Q5XPI4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RNF123Q5XPI4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RNF123Q5XPI4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RNF123Q5XPI4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RNF123Q5XPI4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RNF123Q5XPI4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RNF123Q5XPI4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RNF123Q5XPI4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RNF123Q5XPI4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RNF123Q5XPI4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RNF123Q5XPI4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RNF123Q5XPI4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RNF123Q5XPI4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RNF123Q5XPI4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RNF123Q5XPI4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RNF123Q5XPI4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RNF123Q5XPI4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RNF123Q5XPI4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RNF123Q5XPI4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RNF123Q5XPI4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RNF123Q5XPI4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36■■■■□ 3.35
RNF123Q5XPI4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RNF123Q5XPI4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RNF123Q5XPI4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RNF123Q5XPI4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RNF123Q5XPI4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RNF123Q5XPI4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RNF123Q5XPI4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RNF123Q5XPI4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms