Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SUSD4Q5VX71 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SUSD4Q5VX71 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SUSD4Q5VX71 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SUSD4Q5VX71 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SUSD4Q5VX71 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SUSD4Q5VX71 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SUSD4Q5VX71 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SUSD4Q5VX71 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SUSD4Q5VX71 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SUSD4Q5VX71 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SUSD4Q5VX71 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SUSD4Q5VX71 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SUSD4Q5VX71 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SUSD4Q5VX71 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SUSD4Q5VX71 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SUSD4Q5VX71 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SUSD4Q5VX71 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SUSD4Q5VX71 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SUSD4Q5VX71 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SUSD4Q5VX71 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SUSD4Q5VX71 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SUSD4Q5VX71 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SUSD4Q5VX71 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SUSD4Q5VX71 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SUSD4Q5VX71 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SUSD4Q5VX71 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SUSD4Q5VX71 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SUSD4Q5VX71 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SUSD4Q5VX71 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SUSD4Q5VX71 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SUSD4Q5VX71 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SUSD4Q5VX71 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SUSD4Q5VX71 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
SUSD4Q5VX71 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SUSD4Q5VX71 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SUSD4Q5VX71 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SUSD4Q5VX71 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SUSD4Q5VX71 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SUSD4Q5VX71 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SUSD4Q5VX71 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SUSD4Q5VX71 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SUSD4Q5VX71 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SUSD4Q5VX71 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35■■■■□ 3.19
SUSD4Q5VX71 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SUSD4Q5VX71 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SUSD4Q5VX71 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SUSD4Q5VX71 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SUSD4Q5VX71 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SUSD4Q5VX71 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SUSD4Q5VX71 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SUSD4Q5VX71 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SUSD4Q5VX71 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SUSD4Q5VX71 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SUSD4Q5VX71 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SUSD4Q5VX71 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SUSD4Q5VX71 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SUSD4Q5VX71 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SUSD4Q5VX71 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SUSD4Q5VX71 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SUSD4Q5VX71 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SUSD4Q5VX71 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
SUSD4Q5VX71 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SUSD4Q5VX71 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SUSD4Q5VX71 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
SUSD4Q5VX71 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
SUSD4Q5VX71 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SUSD4Q5VX71 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SUSD4Q5VX71 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SUSD4Q5VX71 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SUSD4Q5VX71 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SUSD4Q5VX71 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SUSD4Q5VX71 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
SUSD4Q5VX71 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SUSD4Q5VX71 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SUSD4Q5VX71 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SUSD4Q5VX71 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SUSD4Q5VX71 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SUSD4Q5VX71 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SUSD4Q5VX71 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SUSD4Q5VX71 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SUSD4Q5VX71 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SUSD4Q5VX71 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SUSD4Q5VX71 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SUSD4Q5VX71 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SUSD4Q5VX71 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SUSD4Q5VX71 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SUSD4Q5VX71 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SUSD4Q5VX71 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SUSD4Q5VX71 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SUSD4Q5VX71 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SUSD4Q5VX71 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
SUSD4Q5VX71 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SUSD4Q5VX71 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SUSD4Q5VX71 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SUSD4Q5VX71 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SUSD4Q5VX71 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SUSD4Q5VX71 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SUSD4Q5VX71 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SUSD4Q5VX71 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189 ms