Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
C1QL3Q5VWW1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1QL3Q5VWW1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1QL3Q5VWW1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QL3Q5VWW1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QL3Q5VWW1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1QL3Q5VWW1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1QL3Q5VWW1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1QL3Q5VWW1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1QL3Q5VWW1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1QL3Q5VWW1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1QL3Q5VWW1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1QL3Q5VWW1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1QL3Q5VWW1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1QL3Q5VWW1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1QL3Q5VWW1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1QL3Q5VWW1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1QL3Q5VWW1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1QL3Q5VWW1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1QL3Q5VWW1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1QL3Q5VWW1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1QL3Q5VWW1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1QL3Q5VWW1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1QL3Q5VWW1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1QL3Q5VWW1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1QL3Q5VWW1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1QL3Q5VWW1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QL3Q5VWW1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1QL3Q5VWW1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1QL3Q5VWW1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1QL3Q5VWW1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1QL3Q5VWW1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1QL3Q5VWW1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1QL3Q5VWW1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1QL3Q5VWW1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1QL3Q5VWW1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1QL3Q5VWW1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1QL3Q5VWW1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1QL3Q5VWW1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1QL3Q5VWW1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1QL3Q5VWW1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1QL3Q5VWW1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1QL3Q5VWW1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1QL3Q5VWW1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1QL3Q5VWW1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1QL3Q5VWW1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QL3Q5VWW1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1QL3Q5VWW1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1QL3Q5VWW1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1QL3Q5VWW1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1QL3Q5VWW1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1QL3Q5VWW1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1QL3Q5VWW1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C1QL3Q5VWW1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1QL3Q5VWW1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1QL3Q5VWW1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1QL3Q5VWW1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1QL3Q5VWW1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1QL3Q5VWW1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1QL3Q5VWW1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QL3Q5VWW1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1QL3Q5VWW1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1QL3Q5VWW1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1QL3Q5VWW1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1QL3Q5VWW1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1QL3Q5VWW1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1QL3Q5VWW1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C1QL3Q5VWW1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1QL3Q5VWW1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C1QL3Q5VWW1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1QL3Q5VWW1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1QL3Q5VWW1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1QL3Q5VWW1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1QL3Q5VWW1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1QL3Q5VWW1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1QL3Q5VWW1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C1QL3Q5VWW1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1QL3Q5VWW1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1QL3Q5VWW1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1QL3Q5VWW1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms