Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRPF38BQ5VTL8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRPF38BQ5VTL8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PRPF38BQ5VTL8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PRPF38BQ5VTL8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PRPF38BQ5VTL8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRPF38BQ5VTL8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRPF38BQ5VTL8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRPF38BQ5VTL8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRPF38BQ5VTL8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRPF38BQ5VTL8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRPF38BQ5VTL8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRPF38BQ5VTL8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRPF38BQ5VTL8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRPF38BQ5VTL8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRPF38BQ5VTL8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRPF38BQ5VTL8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
PRPF38BQ5VTL8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRPF38BQ5VTL8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRPF38BQ5VTL8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
PRPF38BQ5VTL8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRPF38BQ5VTL8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRPF38BQ5VTL8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRPF38BQ5VTL8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRPF38BQ5VTL8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PRPF38BQ5VTL8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRPF38BQ5VTL8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRPF38BQ5VTL8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRPF38BQ5VTL8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PRPF38BQ5VTL8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRPF38BQ5VTL8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRPF38BQ5VTL8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRPF38BQ5VTL8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRPF38BQ5VTL8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRPF38BQ5VTL8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRPF38BQ5VTL8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRPF38BQ5VTL8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRPF38BQ5VTL8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRPF38BQ5VTL8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRPF38BQ5VTL8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRPF38BQ5VTL8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRPF38BQ5VTL8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRPF38BQ5VTL8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRPF38BQ5VTL8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRPF38BQ5VTL8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRPF38BQ5VTL8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRPF38BQ5VTL8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRPF38BQ5VTL8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PRPF38BQ5VTL8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PRPF38BQ5VTL8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRPF38BQ5VTL8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRPF38BQ5VTL8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRPF38BQ5VTL8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRPF38BQ5VTL8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRPF38BQ5VTL8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRPF38BQ5VTL8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRPF38BQ5VTL8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PRPF38BQ5VTL8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRPF38BQ5VTL8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRPF38BQ5VTL8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRPF38BQ5VTL8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRPF38BQ5VTL8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PRPF38BQ5VTL8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PRPF38BQ5VTL8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
PRPF38BQ5VTL8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRPF38BQ5VTL8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRPF38BQ5VTL8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRPF38BQ5VTL8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRPF38BQ5VTL8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRPF38BQ5VTL8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRPF38BQ5VTL8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRPF38BQ5VTL8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRPF38BQ5VTL8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PRPF38BQ5VTL8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRPF38BQ5VTL8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRPF38BQ5VTL8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRPF38BQ5VTL8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PRPF38BQ5VTL8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PRPF38BQ5VTL8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRPF38BQ5VTL8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRPF38BQ5VTL8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PRPF38BQ5VTL8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRPF38BQ5VTL8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRPF38BQ5VTL8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRPF38BQ5VTL8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRPF38BQ5VTL8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRPF38BQ5VTL8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRPF38BQ5VTL8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRPF38BQ5VTL8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRPF38BQ5VTL8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRPF38BQ5VTL8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRPF38BQ5VTL8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRPF38BQ5VTL8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PRPF38BQ5VTL8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRPF38BQ5VTL8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms