Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
RPRD2Q5VT52 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
RPRD2Q5VT52 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
RPRD2Q5VT52 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
RPRD2Q5VT52 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
RPRD2Q5VT52 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
RPRD2Q5VT52 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
RPRD2Q5VT52 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
RPRD2Q5VT52 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
RPRD2Q5VT52 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
RPRD2Q5VT52 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
RPRD2Q5VT52 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
RPRD2Q5VT52 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
RPRD2Q5VT52 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
RPRD2Q5VT52 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
RPRD2Q5VT52 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
RPRD2Q5VT52 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
RPRD2Q5VT52 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
RPRD2Q5VT52 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
RPRD2Q5VT52 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
RPRD2Q5VT52 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
RPRD2Q5VT52 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
RPRD2Q5VT52 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
RPRD2Q5VT52 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
RPRD2Q5VT52 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
RPRD2Q5VT52 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
RPRD2Q5VT52 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
RPRD2Q5VT52 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
RPRD2Q5VT52 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
RPRD2Q5VT52 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
RPRD2Q5VT52 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
RPRD2Q5VT52 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
RPRD2Q5VT52 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
RPRD2Q5VT52 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
RPRD2Q5VT52 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
RPRD2Q5VT52 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.07■■■■■ 4.16
RPRD2Q5VT52 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
RPRD2Q5VT52 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
RPRD2Q5VT52 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
RPRD2Q5VT52 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.02■■■■■ 4.16
RPRD2Q5VT52 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RPRD2Q5VT52 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RPRD2Q5VT52 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RPRD2Q5VT52 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
RPRD2Q5VT52 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
RPRD2Q5VT52 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
RPRD2Q5VT52 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RPRD2Q5VT52 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
RPRD2Q5VT52 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
RPRD2Q5VT52 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
RPRD2Q5VT52 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RPRD2Q5VT52 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RPRD2Q5VT52 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
RPRD2Q5VT52 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
RPRD2Q5VT52 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RPRD2Q5VT52 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
RPRD2Q5VT52 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
RPRD2Q5VT52 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RPRD2Q5VT52 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RPRD2Q5VT52 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RPRD2Q5VT52 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
RPRD2Q5VT52 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
RPRD2Q5VT52 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
RPRD2Q5VT52 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
RPRD2Q5VT52 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
RPRD2Q5VT52 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
RPRD2Q5VT52 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
RPRD2Q5VT52 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
RPRD2Q5VT52 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
RPRD2Q5VT52 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
RPRD2Q5VT52 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
RPRD2Q5VT52 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
RPRD2Q5VT52 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
RPRD2Q5VT52 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
RPRD2Q5VT52 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
RPRD2Q5VT52 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
RPRD2Q5VT52 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
RPRD2Q5VT52 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
RPRD2Q5VT52 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
RPRD2Q5VT52 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
RPRD2Q5VT52 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
RPRD2Q5VT52 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
RPRD2Q5VT52 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
RPRD2Q5VT52 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
RPRD2Q5VT52 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
RPRD2Q5VT52 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
RPRD2Q5VT52 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
RPRD2Q5VT52 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
RPRD2Q5VT52 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
RPRD2Q5VT52 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
RPRD2Q5VT52 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
RPRD2Q5VT52 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
RPRD2Q5VT52 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
RPRD2Q5VT52 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
RPRD2Q5VT52 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
RPRD2Q5VT52 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.07
RPRD2Q5VT52 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
RPRD2Q5VT52 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
RPRD2Q5VT52 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
RPRD2Q5VT52 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms