Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM78Q5T7P6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM78Q5T7P6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM78Q5T7P6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM78Q5T7P6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM78Q5T7P6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM78Q5T7P6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM78Q5T7P6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM78Q5T7P6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM78Q5T7P6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM78Q5T7P6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM78Q5T7P6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM78Q5T7P6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM78Q5T7P6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM78Q5T7P6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM78Q5T7P6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM78Q5T7P6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM78Q5T7P6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM78Q5T7P6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM78Q5T7P6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM78Q5T7P6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM78Q5T7P6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM78Q5T7P6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM78Q5T7P6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM78Q5T7P6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM78Q5T7P6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM78Q5T7P6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM78Q5T7P6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM78Q5T7P6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM78Q5T7P6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM78Q5T7P6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM78Q5T7P6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM78Q5T7P6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM78Q5T7P6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM78Q5T7P6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM78Q5T7P6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM78Q5T7P6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM78Q5T7P6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM78Q5T7P6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM78Q5T7P6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM78Q5T7P6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM78Q5T7P6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM78Q5T7P6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM78Q5T7P6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM78Q5T7P6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM78Q5T7P6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM78Q5T7P6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM78Q5T7P6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM78Q5T7P6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMEM78Q5T7P6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
TMEM78Q5T7P6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM78Q5T7P6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM78Q5T7P6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM78Q5T7P6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM78Q5T7P6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM78Q5T7P6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM78Q5T7P6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM78Q5T7P6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM78Q5T7P6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM78Q5T7P6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM78Q5T7P6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM78Q5T7P6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM78Q5T7P6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM78Q5T7P6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM78Q5T7P6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM78Q5T7P6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM78Q5T7P6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM78Q5T7P6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM78Q5T7P6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM78Q5T7P6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM78Q5T7P6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM78Q5T7P6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM78Q5T7P6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM78Q5T7P6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM78Q5T7P6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM78Q5T7P6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM78Q5T7P6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM78Q5T7P6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM78Q5T7P6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM78Q5T7P6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM78Q5T7P6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM78Q5T7P6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM78Q5T7P6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM78Q5T7P6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM78Q5T7P6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM78Q5T7P6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM78Q5T7P6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM78Q5T7P6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM78Q5T7P6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM78Q5T7P6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM78Q5T7P6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM78Q5T7P6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM78Q5T7P6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM78Q5T7P6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM78Q5T7P6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM78Q5T7P6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM78Q5T7P6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM78Q5T7P6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM78Q5T7P6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM78Q5T7P6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms