Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CAMSAP1Q5T5Y3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CAMSAP1Q5T5Y3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CAMSAP1Q5T5Y3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
CAMSAP1Q5T5Y3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CAMSAP1Q5T5Y3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CAMSAP1Q5T5Y3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
CAMSAP1Q5T5Y3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
CAMSAP1Q5T5Y3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
CAMSAP1Q5T5Y3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CAMSAP1Q5T5Y3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
CAMSAP1Q5T5Y3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CAMSAP1Q5T5Y3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CAMSAP1Q5T5Y3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CAMSAP1Q5T5Y3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CAMSAP1Q5T5Y3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CAMSAP1Q5T5Y3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CAMSAP1Q5T5Y3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
CAMSAP1Q5T5Y3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CAMSAP1Q5T5Y3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CAMSAP1Q5T5Y3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CAMSAP1Q5T5Y3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CAMSAP1Q5T5Y3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CAMSAP1Q5T5Y3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CAMSAP1Q5T5Y3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CAMSAP1Q5T5Y3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CAMSAP1Q5T5Y3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CAMSAP1Q5T5Y3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CAMSAP1Q5T5Y3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CAMSAP1Q5T5Y3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CAMSAP1Q5T5Y3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CAMSAP1Q5T5Y3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CAMSAP1Q5T5Y3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CAMSAP1Q5T5Y3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CAMSAP1Q5T5Y3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CAMSAP1Q5T5Y3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CAMSAP1Q5T5Y3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CAMSAP1Q5T5Y3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CAMSAP1Q5T5Y3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CAMSAP1Q5T5Y3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CAMSAP1Q5T5Y3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CAMSAP1Q5T5Y3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CAMSAP1Q5T5Y3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CAMSAP1Q5T5Y3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CAMSAP1Q5T5Y3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CAMSAP1Q5T5Y3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CAMSAP1Q5T5Y3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CAMSAP1Q5T5Y3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CAMSAP1Q5T5Y3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CAMSAP1Q5T5Y3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CAMSAP1Q5T5Y3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CAMSAP1Q5T5Y3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CAMSAP1Q5T5Y3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CAMSAP1Q5T5Y3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CAMSAP1Q5T5Y3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CAMSAP1Q5T5Y3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms