Protein–RNA interactions for Protein: Q5T481

RBM20, RNA-binding protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM20Q5T481 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM20Q5T481 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM20Q5T481 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM20Q5T481 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM20Q5T481 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM20Q5T481 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM20Q5T481 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM20Q5T481 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM20Q5T481 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM20Q5T481 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM20Q5T481 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM20Q5T481 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM20Q5T481 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM20Q5T481 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM20Q5T481 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM20Q5T481 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM20Q5T481 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM20Q5T481 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM20Q5T481 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBM20Q5T481 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM20Q5T481 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM20Q5T481 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBM20Q5T481 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM20Q5T481 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM20Q5T481 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM20Q5T481 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RBM20Q5T481 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM20Q5T481 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM20Q5T481 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM20Q5T481 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM20Q5T481 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM20Q5T481 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM20Q5T481 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM20Q5T481 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM20Q5T481 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM20Q5T481 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM20Q5T481 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM20Q5T481 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM20Q5T481 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM20Q5T481 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM20Q5T481 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM20Q5T481 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM20Q5T481 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM20Q5T481 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM20Q5T481 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM20Q5T481 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM20Q5T481 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM20Q5T481 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM20Q5T481 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM20Q5T481 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM20Q5T481 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM20Q5T481 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM20Q5T481 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM20Q5T481 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM20Q5T481 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM20Q5T481 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM20Q5T481 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM20Q5T481 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM20Q5T481 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM20Q5T481 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM20Q5T481 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBM20Q5T481 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM20Q5T481 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM20Q5T481 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM20Q5T481 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM20Q5T481 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM20Q5T481 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM20Q5T481 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM20Q5T481 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM20Q5T481 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM20Q5T481 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM20Q5T481 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM20Q5T481 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM20Q5T481 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM20Q5T481 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM20Q5T481 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM20Q5T481 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RBM20Q5T481 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RBM20Q5T481 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM20Q5T481 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM20Q5T481 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM20Q5T481 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM20Q5T481 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM20Q5T481 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM20Q5T481 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM20Q5T481 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM20Q5T481 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM20Q5T481 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM20Q5T481 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM20Q5T481 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM20Q5T481 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM20Q5T481 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM20Q5T481 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM20Q5T481 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM20Q5T481 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM20Q5T481 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM20Q5T481 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM20Q5T481 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM20Q5T481 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM20Q5T481 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms