Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF14Q5SWL7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF14Q5SWL7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF14Q5SWL7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF14Q5SWL7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF14Q5SWL7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF14Q5SWL7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF14Q5SWL7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF14Q5SWL7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF14Q5SWL7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF14Q5SWL7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF14Q5SWL7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF14Q5SWL7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF14Q5SWL7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF14Q5SWL7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF14Q5SWL7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF14Q5SWL7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF14Q5SWL7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF14Q5SWL7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF14Q5SWL7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF14Q5SWL7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF14Q5SWL7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF14Q5SWL7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF14Q5SWL7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF14Q5SWL7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF14Q5SWL7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF14Q5SWL7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF14Q5SWL7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF14Q5SWL7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF14Q5SWL7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF14Q5SWL7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF14Q5SWL7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF14Q5SWL7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PRAMEF14Q5SWL7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF14Q5SWL7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF14Q5SWL7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF14Q5SWL7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF14Q5SWL7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF14Q5SWL7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF14Q5SWL7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF14Q5SWL7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF14Q5SWL7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF14Q5SWL7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF14Q5SWL7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF14Q5SWL7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF14Q5SWL7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF14Q5SWL7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF14Q5SWL7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF14Q5SWL7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF14Q5SWL7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF14Q5SWL7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF14Q5SWL7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF14Q5SWL7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF14Q5SWL7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF14Q5SWL7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF14Q5SWL7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF14Q5SWL7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF14Q5SWL7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF14Q5SWL7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF14Q5SWL7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF14Q5SWL7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF14Q5SWL7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF14Q5SWL7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF14Q5SWL7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF14Q5SWL7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF14Q5SWL7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF14Q5SWL7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF14Q5SWL7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF14Q5SWL7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF14Q5SWL7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF14Q5SWL7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF14Q5SWL7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF14Q5SWL7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF14Q5SWL7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF14Q5SWL7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF14Q5SWL7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF14Q5SWL7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF14Q5SWL7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF14Q5SWL7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF14Q5SWL7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF14Q5SWL7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF14Q5SWL7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF14Q5SWL7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF14Q5SWL7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF14Q5SWL7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF14Q5SWL7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF14Q5SWL7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF14Q5SWL7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRAMEF14Q5SWL7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF14Q5SWL7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF14Q5SWL7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF14Q5SWL7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF14Q5SWL7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF14Q5SWL7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF14Q5SWL7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF14Q5SWL7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF14Q5SWL7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF14Q5SWL7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF14Q5SWL7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF14Q5SWL7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms