Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PERM1Q5SV97 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PERM1Q5SV97 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PERM1Q5SV97 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PERM1Q5SV97 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PERM1Q5SV97 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PERM1Q5SV97 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PERM1Q5SV97 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PERM1Q5SV97 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PERM1Q5SV97 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PERM1Q5SV97 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PERM1Q5SV97 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PERM1Q5SV97 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PERM1Q5SV97 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PERM1Q5SV97 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PERM1Q5SV97 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PERM1Q5SV97 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PERM1Q5SV97 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PERM1Q5SV97 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PERM1Q5SV97 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PERM1Q5SV97 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PERM1Q5SV97 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PERM1Q5SV97 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PERM1Q5SV97 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PERM1Q5SV97 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PERM1Q5SV97 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PERM1Q5SV97 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PERM1Q5SV97 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PERM1Q5SV97 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PERM1Q5SV97 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PERM1Q5SV97 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PERM1Q5SV97 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PERM1Q5SV97 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PERM1Q5SV97 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PERM1Q5SV97 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PERM1Q5SV97 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PERM1Q5SV97 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PERM1Q5SV97 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PERM1Q5SV97 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PERM1Q5SV97 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PERM1Q5SV97 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PERM1Q5SV97 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PERM1Q5SV97 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PERM1Q5SV97 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PERM1Q5SV97 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PERM1Q5SV97 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PERM1Q5SV97 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PERM1Q5SV97 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PERM1Q5SV97 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PERM1Q5SV97 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PERM1Q5SV97 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PERM1Q5SV97 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PERM1Q5SV97 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PERM1Q5SV97 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PERM1Q5SV97 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PERM1Q5SV97 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PERM1Q5SV97 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PERM1Q5SV97 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PERM1Q5SV97 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PERM1Q5SV97 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PERM1Q5SV97 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PERM1Q5SV97 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PERM1Q5SV97 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PERM1Q5SV97 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PERM1Q5SV97 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PERM1Q5SV97 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PERM1Q5SV97 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PERM1Q5SV97 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PERM1Q5SV97 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PERM1Q5SV97 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PERM1Q5SV97 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PERM1Q5SV97 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PERM1Q5SV97 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PERM1Q5SV97 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PERM1Q5SV97 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PERM1Q5SV97 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PERM1Q5SV97 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PERM1Q5SV97 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PERM1Q5SV97 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PERM1Q5SV97 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PERM1Q5SV97 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PERM1Q5SV97 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PERM1Q5SV97 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PERM1Q5SV97 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PERM1Q5SV97 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PERM1Q5SV97 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PERM1Q5SV97 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PERM1Q5SV97 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PERM1Q5SV97 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PERM1Q5SV97 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PERM1Q5SV97 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PERM1Q5SV97 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PERM1Q5SV97 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PERM1Q5SV97 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PERM1Q5SV97 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PERM1Q5SV97 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PERM1Q5SV97 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PERM1Q5SV97 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PERM1Q5SV97 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PERM1Q5SV97 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms