Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ68

SPDYC, Speedy protein C, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYCQ5MJ68 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPDYCQ5MJ68 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPDYCQ5MJ68 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPDYCQ5MJ68 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPDYCQ5MJ68 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPDYCQ5MJ68 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPDYCQ5MJ68 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPDYCQ5MJ68 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPDYCQ5MJ68 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPDYCQ5MJ68 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPDYCQ5MJ68 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPDYCQ5MJ68 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPDYCQ5MJ68 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPDYCQ5MJ68 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPDYCQ5MJ68 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPDYCQ5MJ68 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPDYCQ5MJ68 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPDYCQ5MJ68 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPDYCQ5MJ68 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPDYCQ5MJ68 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPDYCQ5MJ68 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPDYCQ5MJ68 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPDYCQ5MJ68 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPDYCQ5MJ68 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPDYCQ5MJ68 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPDYCQ5MJ68 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPDYCQ5MJ68 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPDYCQ5MJ68 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SPDYCQ5MJ68 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPDYCQ5MJ68 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPDYCQ5MJ68 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPDYCQ5MJ68 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPDYCQ5MJ68 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPDYCQ5MJ68 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPDYCQ5MJ68 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPDYCQ5MJ68 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPDYCQ5MJ68 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPDYCQ5MJ68 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPDYCQ5MJ68 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPDYCQ5MJ68 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPDYCQ5MJ68 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPDYCQ5MJ68 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPDYCQ5MJ68 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPDYCQ5MJ68 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPDYCQ5MJ68 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPDYCQ5MJ68 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPDYCQ5MJ68 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPDYCQ5MJ68 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPDYCQ5MJ68 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPDYCQ5MJ68 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPDYCQ5MJ68 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPDYCQ5MJ68 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPDYCQ5MJ68 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPDYCQ5MJ68 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPDYCQ5MJ68 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPDYCQ5MJ68 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPDYCQ5MJ68 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPDYCQ5MJ68 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPDYCQ5MJ68 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPDYCQ5MJ68 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SPDYCQ5MJ68 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPDYCQ5MJ68 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPDYCQ5MJ68 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPDYCQ5MJ68 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPDYCQ5MJ68 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPDYCQ5MJ68 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPDYCQ5MJ68 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPDYCQ5MJ68 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPDYCQ5MJ68 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SPDYCQ5MJ68 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPDYCQ5MJ68 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPDYCQ5MJ68 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPDYCQ5MJ68 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPDYCQ5MJ68 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPDYCQ5MJ68 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPDYCQ5MJ68 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPDYCQ5MJ68 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SPDYCQ5MJ68 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPDYCQ5MJ68 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPDYCQ5MJ68 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPDYCQ5MJ68 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPDYCQ5MJ68 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPDYCQ5MJ68 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPDYCQ5MJ68 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPDYCQ5MJ68 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPDYCQ5MJ68 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPDYCQ5MJ68 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPDYCQ5MJ68 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPDYCQ5MJ68 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPDYCQ5MJ68 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPDYCQ5MJ68 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPDYCQ5MJ68 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SPDYCQ5MJ68 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPDYCQ5MJ68 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPDYCQ5MJ68 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPDYCQ5MJ68 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPDYCQ5MJ68 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPDYCQ5MJ68 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPDYCQ5MJ68 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPDYCQ5MJ68 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms