Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTN6

WDR38, WD repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR38Q5JTN6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR38Q5JTN6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR38Q5JTN6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR38Q5JTN6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR38Q5JTN6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR38Q5JTN6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR38Q5JTN6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR38Q5JTN6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR38Q5JTN6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR38Q5JTN6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR38Q5JTN6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR38Q5JTN6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR38Q5JTN6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR38Q5JTN6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR38Q5JTN6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR38Q5JTN6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR38Q5JTN6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR38Q5JTN6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR38Q5JTN6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR38Q5JTN6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR38Q5JTN6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR38Q5JTN6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR38Q5JTN6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR38Q5JTN6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR38Q5JTN6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR38Q5JTN6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR38Q5JTN6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR38Q5JTN6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR38Q5JTN6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR38Q5JTN6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR38Q5JTN6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR38Q5JTN6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR38Q5JTN6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR38Q5JTN6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR38Q5JTN6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR38Q5JTN6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR38Q5JTN6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR38Q5JTN6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR38Q5JTN6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR38Q5JTN6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR38Q5JTN6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR38Q5JTN6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR38Q5JTN6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR38Q5JTN6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR38Q5JTN6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR38Q5JTN6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR38Q5JTN6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR38Q5JTN6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR38Q5JTN6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR38Q5JTN6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR38Q5JTN6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR38Q5JTN6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR38Q5JTN6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR38Q5JTN6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR38Q5JTN6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR38Q5JTN6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR38Q5JTN6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR38Q5JTN6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR38Q5JTN6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR38Q5JTN6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR38Q5JTN6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR38Q5JTN6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR38Q5JTN6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR38Q5JTN6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR38Q5JTN6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR38Q5JTN6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR38Q5JTN6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR38Q5JTN6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR38Q5JTN6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR38Q5JTN6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR38Q5JTN6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR38Q5JTN6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR38Q5JTN6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR38Q5JTN6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR38Q5JTN6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR38Q5JTN6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR38Q5JTN6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR38Q5JTN6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR38Q5JTN6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR38Q5JTN6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR38Q5JTN6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR38Q5JTN6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR38Q5JTN6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR38Q5JTN6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR38Q5JTN6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR38Q5JTN6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR38Q5JTN6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR38Q5JTN6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR38Q5JTN6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR38Q5JTN6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR38Q5JTN6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR38Q5JTN6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR38Q5JTN6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR38Q5JTN6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR38Q5JTN6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR38Q5JTN6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR38Q5JTN6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR38Q5JTN6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR38Q5JTN6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR38Q5JTN6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms