Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAN3Q58A45 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAN3Q58A45 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAN3Q58A45 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAN3Q58A45 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAN3Q58A45 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAN3Q58A45 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAN3Q58A45 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAN3Q58A45 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAN3Q58A45 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAN3Q58A45 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAN3Q58A45 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAN3Q58A45 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAN3Q58A45 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PAN3Q58A45 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAN3Q58A45 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAN3Q58A45 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAN3Q58A45 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAN3Q58A45 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAN3Q58A45 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAN3Q58A45 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAN3Q58A45 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAN3Q58A45 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAN3Q58A45 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAN3Q58A45 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAN3Q58A45 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAN3Q58A45 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAN3Q58A45 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAN3Q58A45 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAN3Q58A45 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAN3Q58A45 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAN3Q58A45 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAN3Q58A45 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAN3Q58A45 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAN3Q58A45 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAN3Q58A45 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAN3Q58A45 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAN3Q58A45 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAN3Q58A45 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAN3Q58A45 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAN3Q58A45 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAN3Q58A45 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAN3Q58A45 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAN3Q58A45 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAN3Q58A45 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAN3Q58A45 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAN3Q58A45 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAN3Q58A45 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAN3Q58A45 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAN3Q58A45 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAN3Q58A45 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAN3Q58A45 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAN3Q58A45 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAN3Q58A45 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAN3Q58A45 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAN3Q58A45 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAN3Q58A45 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAN3Q58A45 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAN3Q58A45 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAN3Q58A45 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAN3Q58A45 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAN3Q58A45 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAN3Q58A45 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PAN3Q58A45 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAN3Q58A45 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAN3Q58A45 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PAN3Q58A45 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms