Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q56UQ5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q56UQ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q56UQ5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q56UQ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q56UQ5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q56UQ5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q56UQ5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q56UQ5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q56UQ5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q56UQ5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q56UQ5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q56UQ5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q56UQ5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q56UQ5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q56UQ5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q56UQ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q56UQ5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q56UQ5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q56UQ5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q56UQ5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q56UQ5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q56UQ5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Q56UQ5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q56UQ5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q56UQ5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Q56UQ5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q56UQ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q56UQ5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q56UQ5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q56UQ5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q56UQ5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q56UQ5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q56UQ5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q56UQ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q56UQ5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q56UQ5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q56UQ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q56UQ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q56UQ5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q56UQ5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q56UQ5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q56UQ5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q56UQ5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q56UQ5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q56UQ5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q56UQ5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q56UQ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q56UQ5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q56UQ5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q56UQ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q56UQ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q56UQ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q56UQ5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q56UQ5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q56UQ5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q56UQ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q56UQ5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q56UQ5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q56UQ5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q56UQ5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q56UQ5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q56UQ5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q56UQ5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q56UQ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q56UQ5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q56UQ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q56UQ5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q56UQ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q56UQ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q56UQ5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q56UQ5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q56UQ5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q56UQ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q56UQ5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q56UQ5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q56UQ5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q56UQ5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q56UQ5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q56UQ5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q56UQ5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q56UQ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q56UQ5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q56UQ5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q56UQ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q56UQ5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q56UQ5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q56UQ5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q56UQ5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q56UQ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q56UQ5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q56UQ5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q56UQ5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q56UQ5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q56UQ5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q56UQ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q56UQ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q56UQ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q56UQ5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q56UQ5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms