Protein–RNA interactions for Protein: Q52LG2

KRTAP13-2, Keratin-associated protein 13-2, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-2Q52LG2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP13-2Q52LG2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP13-2Q52LG2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP13-2Q52LG2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP13-2Q52LG2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP13-2Q52LG2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP13-2Q52LG2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP13-2Q52LG2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP13-2Q52LG2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP13-2Q52LG2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP13-2Q52LG2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP13-2Q52LG2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP13-2Q52LG2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP13-2Q52LG2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP13-2Q52LG2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP13-2Q52LG2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP13-2Q52LG2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP13-2Q52LG2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP13-2Q52LG2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP13-2Q52LG2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP13-2Q52LG2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP13-2Q52LG2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP13-2Q52LG2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP13-2Q52LG2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP13-2Q52LG2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP13-2Q52LG2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP13-2Q52LG2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP13-2Q52LG2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP13-2Q52LG2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP13-2Q52LG2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP13-2Q52LG2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP13-2Q52LG2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRTAP13-2Q52LG2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP13-2Q52LG2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP13-2Q52LG2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP13-2Q52LG2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP13-2Q52LG2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP13-2Q52LG2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP13-2Q52LG2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP13-2Q52LG2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP13-2Q52LG2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP13-2Q52LG2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP13-2Q52LG2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP13-2Q52LG2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP13-2Q52LG2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP13-2Q52LG2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP13-2Q52LG2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP13-2Q52LG2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP13-2Q52LG2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP13-2Q52LG2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP13-2Q52LG2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP13-2Q52LG2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP13-2Q52LG2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP13-2Q52LG2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP13-2Q52LG2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP13-2Q52LG2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP13-2Q52LG2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP13-2Q52LG2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP13-2Q52LG2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP13-2Q52LG2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms