Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP13-3Q3SY46 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP13-3Q3SY46 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP13-3Q3SY46 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP13-3Q3SY46 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP13-3Q3SY46 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP13-3Q3SY46 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP13-3Q3SY46 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP13-3Q3SY46 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP13-3Q3SY46 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP13-3Q3SY46 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP13-3Q3SY46 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP13-3Q3SY46 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP13-3Q3SY46 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP13-3Q3SY46 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP13-3Q3SY46 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP13-3Q3SY46 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP13-3Q3SY46 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP13-3Q3SY46 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP13-3Q3SY46 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP13-3Q3SY46 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP13-3Q3SY46 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP13-3Q3SY46 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP13-3Q3SY46 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP13-3Q3SY46 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP13-3Q3SY46 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP13-3Q3SY46 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP13-3Q3SY46 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP13-3Q3SY46 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP13-3Q3SY46 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP13-3Q3SY46 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP13-3Q3SY46 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP13-3Q3SY46 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP13-3Q3SY46 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP13-3Q3SY46 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms