Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
P3H1Q32P28 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
P3H1Q32P28 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
P3H1Q32P28 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
P3H1Q32P28 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
P3H1Q32P28 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
P3H1Q32P28 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
P3H1Q32P28 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
P3H1Q32P28 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
P3H1Q32P28 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H1Q32P28 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H1Q32P28 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H1Q32P28 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H1Q32P28 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
P3H1Q32P28 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H1Q32P28 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H1Q32P28 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H1Q32P28 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
P3H1Q32P28 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
P3H1Q32P28 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
P3H1Q32P28 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
P3H1Q32P28 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
P3H1Q32P28 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
P3H1Q32P28 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
P3H1Q32P28 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
P3H1Q32P28 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
P3H1Q32P28 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
P3H1Q32P28 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
P3H1Q32P28 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
P3H1Q32P28 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H1Q32P28 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H1Q32P28 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H1Q32P28 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H1Q32P28 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H1Q32P28 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H1Q32P28 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H1Q32P28 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H1Q32P28 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H1Q32P28 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
P3H1Q32P28 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
P3H1Q32P28 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
P3H1Q32P28 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
P3H1Q32P28 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
P3H1Q32P28 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
P3H1Q32P28 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
P3H1Q32P28 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
P3H1Q32P28 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
P3H1Q32P28 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
P3H1Q32P28 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
P3H1Q32P28 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
P3H1Q32P28 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
P3H1Q32P28 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
P3H1Q32P28 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
P3H1Q32P28 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
P3H1Q32P28 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
P3H1Q32P28 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
P3H1Q32P28 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
P3H1Q32P28 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
P3H1Q32P28 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
P3H1Q32P28 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
P3H1Q32P28 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
P3H1Q32P28 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
P3H1Q32P28 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
P3H1Q32P28 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
P3H1Q32P28 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
P3H1Q32P28 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
P3H1Q32P28 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
P3H1Q32P28 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
P3H1Q32P28 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
P3H1Q32P28 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
P3H1Q32P28 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
P3H1Q32P28 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
P3H1Q32P28 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
P3H1Q32P28 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
P3H1Q32P28 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
P3H1Q32P28 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
P3H1Q32P28 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
P3H1Q32P28 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
P3H1Q32P28 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
P3H1Q32P28 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
P3H1Q32P28 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
P3H1Q32P28 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
P3H1Q32P28 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
P3H1Q32P28 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H1Q32P28 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H1Q32P28 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
P3H1Q32P28 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
P3H1Q32P28 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H1Q32P28 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H1Q32P28 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H1Q32P28 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H1Q32P28 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H1Q32P28 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H1Q32P28 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H1Q32P28 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H1Q32P28 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H1Q32P28 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H1Q32P28 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H1Q32P28 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H1Q32P28 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms