Protein–RNA interactions for Protein: Q32MK0

MYLK3, Myosin light chain kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYLK3Q32MK0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYLK3Q32MK0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYLK3Q32MK0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYLK3Q32MK0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYLK3Q32MK0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYLK3Q32MK0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYLK3Q32MK0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYLK3Q32MK0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYLK3Q32MK0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MYLK3Q32MK0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYLK3Q32MK0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYLK3Q32MK0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYLK3Q32MK0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYLK3Q32MK0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYLK3Q32MK0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYLK3Q32MK0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYLK3Q32MK0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYLK3Q32MK0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYLK3Q32MK0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYLK3Q32MK0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYLK3Q32MK0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYLK3Q32MK0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYLK3Q32MK0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYLK3Q32MK0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYLK3Q32MK0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYLK3Q32MK0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYLK3Q32MK0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYLK3Q32MK0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYLK3Q32MK0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYLK3Q32MK0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYLK3Q32MK0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MYLK3Q32MK0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYLK3Q32MK0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYLK3Q32MK0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYLK3Q32MK0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYLK3Q32MK0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYLK3Q32MK0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MYLK3Q32MK0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYLK3Q32MK0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYLK3Q32MK0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYLK3Q32MK0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYLK3Q32MK0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYLK3Q32MK0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYLK3Q32MK0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MYLK3Q32MK0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYLK3Q32MK0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYLK3Q32MK0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYLK3Q32MK0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYLK3Q32MK0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYLK3Q32MK0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYLK3Q32MK0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYLK3Q32MK0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYLK3Q32MK0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYLK3Q32MK0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYLK3Q32MK0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYLK3Q32MK0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYLK3Q32MK0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYLK3Q32MK0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYLK3Q32MK0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYLK3Q32MK0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYLK3Q32MK0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYLK3Q32MK0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYLK3Q32MK0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYLK3Q32MK0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYLK3Q32MK0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYLK3Q32MK0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYLK3Q32MK0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYLK3Q32MK0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYLK3Q32MK0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYLK3Q32MK0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYLK3Q32MK0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYLK3Q32MK0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYLK3Q32MK0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MYLK3Q32MK0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYLK3Q32MK0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYLK3Q32MK0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYLK3Q32MK0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYLK3Q32MK0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYLK3Q32MK0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYLK3Q32MK0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYLK3Q32MK0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYLK3Q32MK0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYLK3Q32MK0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MYLK3Q32MK0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYLK3Q32MK0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYLK3Q32MK0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYLK3Q32MK0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MYLK3Q32MK0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYLK3Q32MK0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYLK3Q32MK0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYLK3Q32MK0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYLK3Q32MK0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYLK3Q32MK0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MYLK3Q32MK0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYLK3Q32MK0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYLK3Q32MK0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYLK3Q32MK0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYLK3Q32MK0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYLK3Q32MK0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYLK3Q32MK0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms