Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ8

DEFB112, Beta-defensin 112, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB112Q30KQ8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEFB112Q30KQ8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEFB112Q30KQ8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEFB112Q30KQ8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEFB112Q30KQ8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEFB112Q30KQ8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEFB112Q30KQ8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEFB112Q30KQ8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEFB112Q30KQ8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEFB112Q30KQ8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEFB112Q30KQ8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEFB112Q30KQ8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEFB112Q30KQ8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEFB112Q30KQ8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEFB112Q30KQ8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DEFB112Q30KQ8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEFB112Q30KQ8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DEFB112Q30KQ8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEFB112Q30KQ8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEFB112Q30KQ8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEFB112Q30KQ8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEFB112Q30KQ8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DEFB112Q30KQ8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEFB112Q30KQ8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DEFB112Q30KQ8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEFB112Q30KQ8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEFB112Q30KQ8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEFB112Q30KQ8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEFB112Q30KQ8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEFB112Q30KQ8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEFB112Q30KQ8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEFB112Q30KQ8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEFB112Q30KQ8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEFB112Q30KQ8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEFB112Q30KQ8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEFB112Q30KQ8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEFB112Q30KQ8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEFB112Q30KQ8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEFB112Q30KQ8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEFB112Q30KQ8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEFB112Q30KQ8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEFB112Q30KQ8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEFB112Q30KQ8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEFB112Q30KQ8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DEFB112Q30KQ8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEFB112Q30KQ8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEFB112Q30KQ8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DEFB112Q30KQ8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DEFB112Q30KQ8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEFB112Q30KQ8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEFB112Q30KQ8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEFB112Q30KQ8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEFB112Q30KQ8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEFB112Q30KQ8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEFB112Q30KQ8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEFB112Q30KQ8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEFB112Q30KQ8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEFB112Q30KQ8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEFB112Q30KQ8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEFB112Q30KQ8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEFB112Q30KQ8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEFB112Q30KQ8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEFB112Q30KQ8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEFB112Q30KQ8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEFB112Q30KQ8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEFB112Q30KQ8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEFB112Q30KQ8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEFB112Q30KQ8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEFB112Q30KQ8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEFB112Q30KQ8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEFB112Q30KQ8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DEFB112Q30KQ8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEFB112Q30KQ8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEFB112Q30KQ8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEFB112Q30KQ8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEFB112Q30KQ8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEFB112Q30KQ8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEFB112Q30KQ8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DEFB112Q30KQ8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEFB112Q30KQ8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEFB112Q30KQ8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEFB112Q30KQ8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEFB112Q30KQ8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEFB112Q30KQ8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEFB112Q30KQ8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DEFB112Q30KQ8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DEFB112Q30KQ8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEFB112Q30KQ8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DEFB112Q30KQ8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEFB112Q30KQ8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEFB112Q30KQ8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEFB112Q30KQ8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEFB112Q30KQ8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DEFB112Q30KQ8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFB112Q30KQ8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB112Q30KQ8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB112Q30KQ8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB112Q30KQ8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB112Q30KQ8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB112Q30KQ8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms