Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC5A9Q2M3M2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC5A9Q2M3M2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC5A9Q2M3M2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC5A9Q2M3M2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC5A9Q2M3M2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC5A9Q2M3M2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC5A9Q2M3M2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC5A9Q2M3M2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC5A9Q2M3M2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SLC5A9Q2M3M2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC5A9Q2M3M2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC5A9Q2M3M2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC5A9Q2M3M2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC5A9Q2M3M2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC5A9Q2M3M2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC5A9Q2M3M2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC5A9Q2M3M2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC5A9Q2M3M2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC5A9Q2M3M2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC5A9Q2M3M2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC5A9Q2M3M2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC5A9Q2M3M2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC5A9Q2M3M2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC5A9Q2M3M2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC5A9Q2M3M2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC5A9Q2M3M2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC5A9Q2M3M2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A9Q2M3M2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A9Q2M3M2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC5A9Q2M3M2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC5A9Q2M3M2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC5A9Q2M3M2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A9Q2M3M2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC5A9Q2M3M2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC5A9Q2M3M2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC5A9Q2M3M2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC5A9Q2M3M2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC5A9Q2M3M2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC5A9Q2M3M2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC5A9Q2M3M2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC5A9Q2M3M2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC5A9Q2M3M2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC5A9Q2M3M2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC5A9Q2M3M2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC5A9Q2M3M2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC5A9Q2M3M2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC5A9Q2M3M2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC5A9Q2M3M2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC5A9Q2M3M2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC5A9Q2M3M2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A9Q2M3M2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A9Q2M3M2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A9Q2M3M2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A9Q2M3M2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC5A9Q2M3M2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC5A9Q2M3M2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC5A9Q2M3M2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC5A9Q2M3M2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC5A9Q2M3M2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC5A9Q2M3M2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC5A9Q2M3M2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC5A9Q2M3M2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC5A9Q2M3M2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC5A9Q2M3M2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC5A9Q2M3M2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC5A9Q2M3M2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC5A9Q2M3M2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC5A9Q2M3M2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC5A9Q2M3M2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC5A9Q2M3M2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC5A9Q2M3M2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC5A9Q2M3M2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC5A9Q2M3M2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC5A9Q2M3M2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC5A9Q2M3M2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC5A9Q2M3M2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC5A9Q2M3M2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC5A9Q2M3M2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC5A9Q2M3M2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC5A9Q2M3M2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC5A9Q2M3M2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC5A9Q2M3M2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC5A9Q2M3M2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC5A9Q2M3M2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC5A9Q2M3M2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC5A9Q2M3M2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC5A9Q2M3M2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC5A9Q2M3M2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC5A9Q2M3M2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC5A9Q2M3M2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC5A9Q2M3M2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC5A9Q2M3M2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC5A9Q2M3M2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC5A9Q2M3M2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC5A9Q2M3M2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC5A9Q2M3M2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC5A9Q2M3M2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC5A9Q2M3M2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC5A9Q2M3M2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms