Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RFX7Q2KHR2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RFX7Q2KHR2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RFX7Q2KHR2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
RFX7Q2KHR2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RFX7Q2KHR2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RFX7Q2KHR2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RFX7Q2KHR2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RFX7Q2KHR2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RFX7Q2KHR2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RFX7Q2KHR2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RFX7Q2KHR2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RFX7Q2KHR2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
RFX7Q2KHR2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RFX7Q2KHR2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RFX7Q2KHR2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RFX7Q2KHR2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RFX7Q2KHR2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RFX7Q2KHR2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RFX7Q2KHR2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
RFX7Q2KHR2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RFX7Q2KHR2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RFX7Q2KHR2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RFX7Q2KHR2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RFX7Q2KHR2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
RFX7Q2KHR2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RFX7Q2KHR2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RFX7Q2KHR2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RFX7Q2KHR2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RFX7Q2KHR2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RFX7Q2KHR2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RFX7Q2KHR2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RFX7Q2KHR2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RFX7Q2KHR2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RFX7Q2KHR2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RFX7Q2KHR2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RFX7Q2KHR2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RFX7Q2KHR2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RFX7Q2KHR2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RFX7Q2KHR2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RFX7Q2KHR2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RFX7Q2KHR2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RFX7Q2KHR2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RFX7Q2KHR2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RFX7Q2KHR2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RFX7Q2KHR2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RFX7Q2KHR2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RFX7Q2KHR2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RFX7Q2KHR2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RFX7Q2KHR2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RFX7Q2KHR2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RFX7Q2KHR2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RFX7Q2KHR2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
RFX7Q2KHR2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RFX7Q2KHR2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RFX7Q2KHR2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RFX7Q2KHR2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
RFX7Q2KHR2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RFX7Q2KHR2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RFX7Q2KHR2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RFX7Q2KHR2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RFX7Q2KHR2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RFX7Q2KHR2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RFX7Q2KHR2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RFX7Q2KHR2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RFX7Q2KHR2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RFX7Q2KHR2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RFX7Q2KHR2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RFX7Q2KHR2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RFX7Q2KHR2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
RFX7Q2KHR2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RFX7Q2KHR2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RFX7Q2KHR2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RFX7Q2KHR2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RFX7Q2KHR2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RFX7Q2KHR2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RFX7Q2KHR2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RFX7Q2KHR2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RFX7Q2KHR2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RFX7Q2KHR2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RFX7Q2KHR2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RFX7Q2KHR2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RFX7Q2KHR2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RFX7Q2KHR2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RFX7Q2KHR2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
RFX7Q2KHR2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
RFX7Q2KHR2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RFX7Q2KHR2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RFX7Q2KHR2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RFX7Q2KHR2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RFX7Q2KHR2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RFX7Q2KHR2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RFX7Q2KHR2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RFX7Q2KHR2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RFX7Q2KHR2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
RFX7Q2KHR2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RFX7Q2KHR2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RFX7Q2KHR2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RFX7Q2KHR2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RFX7Q2KHR2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms