Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPROQ16827 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPROQ16827 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPROQ16827 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPROQ16827 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPROQ16827 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPROQ16827 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPROQ16827 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPROQ16827 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPROQ16827 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPROQ16827 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPROQ16827 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPROQ16827 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPROQ16827 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPROQ16827 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPROQ16827 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPROQ16827 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPROQ16827 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPROQ16827 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPROQ16827 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPROQ16827 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPROQ16827 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPROQ16827 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPROQ16827 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPROQ16827 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPROQ16827 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPROQ16827 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPROQ16827 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPROQ16827 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPROQ16827 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPROQ16827 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPROQ16827 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPROQ16827 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPROQ16827 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPROQ16827 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPROQ16827 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPROQ16827 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPROQ16827 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPROQ16827 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPROQ16827 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPROQ16827 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPROQ16827 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPROQ16827 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPROQ16827 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPROQ16827 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPROQ16827 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPROQ16827 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPROQ16827 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPROQ16827 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPROQ16827 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPROQ16827 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPROQ16827 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPROQ16827 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPROQ16827 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPROQ16827 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPROQ16827 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPROQ16827 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPROQ16827 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPROQ16827 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPROQ16827 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPROQ16827 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPROQ16827 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPROQ16827 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPROQ16827 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPROQ16827 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPROQ16827 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPROQ16827 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPROQ16827 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPROQ16827 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPROQ16827 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPROQ16827 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPROQ16827 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPROQ16827 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPROQ16827 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPROQ16827 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PTPROQ16827 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PTPROQ16827 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPROQ16827 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPROQ16827 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPROQ16827 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPROQ16827 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPROQ16827 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPROQ16827 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPROQ16827 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPROQ16827 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPROQ16827 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPROQ16827 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPROQ16827 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPROQ16827 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPROQ16827 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPROQ16827 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPROQ16827 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPROQ16827 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPROQ16827 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPROQ16827 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPROQ16827 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPROQ16827 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPROQ16827 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPROQ16827 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPROQ16827 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
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