Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCK2Q16822 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCK2Q16822 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCK2Q16822 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCK2Q16822 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCK2Q16822 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCK2Q16822 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCK2Q16822 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCK2Q16822 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCK2Q16822 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCK2Q16822 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCK2Q16822 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCK2Q16822 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCK2Q16822 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCK2Q16822 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCK2Q16822 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCK2Q16822 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCK2Q16822 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCK2Q16822 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCK2Q16822 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCK2Q16822 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCK2Q16822 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCK2Q16822 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCK2Q16822 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCK2Q16822 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCK2Q16822 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCK2Q16822 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCK2Q16822 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCK2Q16822 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCK2Q16822 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCK2Q16822 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCK2Q16822 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCK2Q16822 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK2Q16822 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK2Q16822 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK2Q16822 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCK2Q16822 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCK2Q16822 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCK2Q16822 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCK2Q16822 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCK2Q16822 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCK2Q16822 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCK2Q16822 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCK2Q16822 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCK2Q16822 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCK2Q16822 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCK2Q16822 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCK2Q16822 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCK2Q16822 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCK2Q16822 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCK2Q16822 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCK2Q16822 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCK2Q16822 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK2Q16822 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK2Q16822 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK2Q16822 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK2Q16822 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK2Q16822 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCK2Q16822 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCK2Q16822 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCK2Q16822 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCK2Q16822 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCK2Q16822 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCK2Q16822 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCK2Q16822 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCK2Q16822 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCK2Q16822 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCK2Q16822 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCK2Q16822 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCK2Q16822 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCK2Q16822 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCK2Q16822 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCK2Q16822 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCK2Q16822 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCK2Q16822 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCK2Q16822 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCK2Q16822 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCK2Q16822 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCK2Q16822 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCK2Q16822 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCK2Q16822 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCK2Q16822 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCK2Q16822 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCK2Q16822 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCK2Q16822 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCK2Q16822 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCK2Q16822 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCK2Q16822 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCK2Q16822 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCK2Q16822 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCK2Q16822 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCK2Q16822 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCK2Q16822 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCK2Q16822 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCK2Q16822 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCK2Q16822 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCK2Q16822 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCK2Q16822 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCK2Q16822 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCK2Q16822 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms