Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKN3Q16667 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDKN3Q16667 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDKN3Q16667 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDKN3Q16667 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDKN3Q16667 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDKN3Q16667 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDKN3Q16667 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDKN3Q16667 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDKN3Q16667 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDKN3Q16667 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDKN3Q16667 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDKN3Q16667 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDKN3Q16667 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDKN3Q16667 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDKN3Q16667 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDKN3Q16667 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDKN3Q16667 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDKN3Q16667 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDKN3Q16667 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDKN3Q16667 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CDKN3Q16667 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDKN3Q16667 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDKN3Q16667 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDKN3Q16667 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDKN3Q16667 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDKN3Q16667 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CDKN3Q16667 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDKN3Q16667 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDKN3Q16667 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDKN3Q16667 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDKN3Q16667 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDKN3Q16667 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDKN3Q16667 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDKN3Q16667 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDKN3Q16667 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDKN3Q16667 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDKN3Q16667 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDKN3Q16667 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDKN3Q16667 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDKN3Q16667 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDKN3Q16667 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDKN3Q16667 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDKN3Q16667 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDKN3Q16667 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDKN3Q16667 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDKN3Q16667 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDKN3Q16667 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDKN3Q16667 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDKN3Q16667 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDKN3Q16667 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDKN3Q16667 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDKN3Q16667 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDKN3Q16667 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDKN3Q16667 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDKN3Q16667 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDKN3Q16667 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDKN3Q16667 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDKN3Q16667 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDKN3Q16667 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDKN3Q16667 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDKN3Q16667 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDKN3Q16667 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDKN3Q16667 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDKN3Q16667 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDKN3Q16667 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CDKN3Q16667 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDKN3Q16667 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDKN3Q16667 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDKN3Q16667 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDKN3Q16667 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDKN3Q16667 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDKN3Q16667 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDKN3Q16667 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDKN3Q16667 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDKN3Q16667 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDKN3Q16667 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDKN3Q16667 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDKN3Q16667 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDKN3Q16667 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDKN3Q16667 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDKN3Q16667 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDKN3Q16667 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
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