Protein–RNA interactions for Protein: Q15714

TSC22D1, TSC22 domain family protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1Q15714 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC22D1Q15714 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC22D1Q15714 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC22D1Q15714 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC22D1Q15714 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC22D1Q15714 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC22D1Q15714 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC22D1Q15714 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSC22D1Q15714 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC22D1Q15714 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC22D1Q15714 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC22D1Q15714 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC22D1Q15714 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC22D1Q15714 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC22D1Q15714 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC22D1Q15714 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC22D1Q15714 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC22D1Q15714 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC22D1Q15714 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC22D1Q15714 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC22D1Q15714 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC22D1Q15714 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC22D1Q15714 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC22D1Q15714 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC22D1Q15714 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC22D1Q15714 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC22D1Q15714 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC22D1Q15714 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC22D1Q15714 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC22D1Q15714 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC22D1Q15714 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC22D1Q15714 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC22D1Q15714 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC22D1Q15714 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC22D1Q15714 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC22D1Q15714 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC22D1Q15714 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSC22D1Q15714 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC22D1Q15714 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC22D1Q15714 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC22D1Q15714 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC22D1Q15714 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC22D1Q15714 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC22D1Q15714 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSC22D1Q15714 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSC22D1Q15714 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC22D1Q15714 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC22D1Q15714 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC22D1Q15714 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC22D1Q15714 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC22D1Q15714 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC22D1Q15714 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC22D1Q15714 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC22D1Q15714 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC22D1Q15714 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC22D1Q15714 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC22D1Q15714 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC22D1Q15714 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC22D1Q15714 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC22D1Q15714 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC22D1Q15714 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC22D1Q15714 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC22D1Q15714 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC22D1Q15714 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC22D1Q15714 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSC22D1Q15714 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC22D1Q15714 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC22D1Q15714 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC22D1Q15714 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC22D1Q15714 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC22D1Q15714 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC22D1Q15714 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC22D1Q15714 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC22D1Q15714 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC22D1Q15714 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC22D1Q15714 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC22D1Q15714 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC22D1Q15714 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC22D1Q15714 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC22D1Q15714 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC22D1Q15714 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC22D1Q15714 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC22D1Q15714 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC22D1Q15714 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC22D1Q15714 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC22D1Q15714 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC22D1Q15714 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC22D1Q15714 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC22D1Q15714 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC22D1Q15714 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC22D1Q15714 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC22D1Q15714 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC22D1Q15714 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC22D1Q15714 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC22D1Q15714 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC22D1Q15714 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC22D1Q15714 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC22D1Q15714 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC22D1Q15714 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC22D1Q15714 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms