Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 DDX55-213ENST00000545042 450 ntTSL 512.1□□□□□ -0.471e-13■■■■■ 92.4
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SF3B4Q15427 LENG8-204ENST00000436479 320 ntTSL 59.37□□□□□ -0.913e-17■■■■■ 92.4
SF3B4Q15427 LENG8-207ENST00000462541 456 ntTSL 29.29□□□□□ -0.923e-17■■■■■ 92.4
SF3B4Q15427 MIIP-206ENST00000492256 806 ntTSL 213.15□□□□□ -0.39e-19■■■■■ 92.1
SF3B4Q15427 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.38□□□□□ -1.559e-19■■■■■ 92.1
SF3B4Q15427 AFDN-215ENST00000497596 728 ntTSL 27.34□□□□□ -1.233e-28■■■■■ 91.9
SF3B4Q15427 FUS-211ENST00000568901 521 ntTSL 29.62□□□□□ -0.876e-9■■■■■ 91.5
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SF3B4Q15427 UBR4-216ENST00000494503 598 ntTSL 38.84□□□□□ -0.993e-44■■■■■ 91.2
SF3B4Q15427 HNRNPH1-248ENST00000524179 598 ntTSL 213.4□□□□□ -0.265e-11■■■■■ 91.1
SF3B4Q15427 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 90.7
SF3B4Q15427 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 419.16■□□□□ 0.662e-8■■■■■ 90.7
SF3B4Q15427 PCGF3-209ENST00000475288 604 ntTSL 316.39■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 90.7
SF3B4Q15427 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.55□□□□□ -24e-14■■■■■ 90.4
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SF3B4Q15427 DCAF8-213ENST00000477163 513 ntTSL 39.58□□□□□ -0.882e-19■■■■■ 89.3
SF3B4Q15427 DCAF8-217ENST00000497354 738 ntTSL 58.25□□□□□ -1.092e-19■■■■■ 89.3
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SF3B4Q15427 APMAP-202ENST00000451442 2117 ntTSL 512.72□□□□□ -0.378e-21■■■■■ 89.1
SF3B4Q15427 SAT2-214ENST00000576846 1563 nt21.96■■□□□ 1.111e-9■■■■■ 87.8
SF3B4Q15427 SAT2-202ENST00000380466 974 ntTSL 1 (best)12.57□□□□□ -0.41e-9■■■■■ 87.8
SF3B4Q15427 SAT2-213ENST00000576686 582 ntTSL 212.53□□□□□ -0.41e-9■■■■■ 87.8
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SF3B4Q15427 SAT2-212ENST00000576579 535 ntTSL 39.67□□□□□ -0.861e-9■■■■■ 87.8
SF3B4Q15427 SAT2-201ENST00000269298 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.941e-9■■■■■ 87.8
SF3B4Q15427 SAT2-203ENST00000570850 685 ntTSL 38.19□□□□□ -1.11e-9■■■■■ 87.8
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SF3B4Q15427 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 83.5
SF3B4Q15427 DNAJB1-202ENST00000396969 1287 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 83.5
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SF3B4Q15427 DNMT3A-213ENST00000484184 619 ntTSL 311.62□□□□□ -0.554e-8■■■■■ 83.2
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SF3B4Q15427 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.46e-25■■■■■ 82.3
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SF3B4Q15427 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.676e-25■■■■■ 82.3
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SF3B4Q15427 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 55.49□□□□□ -1.537e-10■■■■■ 81.8
SF3B4Q15427 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 53.19□□□□□ -1.97e-10■■■■■ 81.8
SF3B4Q15427 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 52.97□□□□□ -1.937e-10■■■■■ 81.8
SF3B4Q15427 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.187e-10■■■■■ 81.8
SF3B4Q15427 CCDC14-214ENST00000478956 555 ntTSL 412.43□□□□□ -0.425e-15■■■■■ 81.5
SF3B4Q15427 HSPG2-205ENST00000427897 589 ntTSL 518.89■□□□□ 0.618e-9■■■■■ 81.5
SF3B4Q15427 RPL14-209ENST00000481798 604 ntTSL 36.29□□□□□ -1.42e-17■■■■■ 80.9
SF3B4Q15427 RPL14-205ENST00000461368 170 ntTSL 21.35□□□□□ -2.192e-17■■■■■ 80.9
SF3B4Q15427 ZC3H12A-203ENST00000472312 593 ntTSL 215.62■□□□□ 0.095e-10■■■■■ 80.8
SF3B4Q15427 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.015e-10■■■■■ 80.8
SF3B4Q15427 ZC3H12A-204ENST00000640233 2721 ntTSL 515.06■□□□□ 05e-10■■■■■ 80.8
SF3B4Q15427 MIR6732-201ENST00000619365 60 ntBASIC7.93□□□□□ -1.145e-10■■■■■ 80.8
SF3B4Q15427 COX19-201ENST00000344111 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.68e-48■■■■■ 80.3
SF3B4Q15427 SPG7-213ENST00000566221 734 ntTSL 313.27□□□□□ -0.294e-16■■■■■ 80.3
SF3B4Q15427 SPG7-211ENST00000565370 686 ntTSL 311.25□□□□□ -0.614e-16■■■■■ 80.3
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SF3B4Q15427 TTC31-207ENST00000459957 873 ntTSL 218.61■□□□□ 0.571e-16■■■■■ 80.1
SF3B4Q15427 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.011e-16■■■■■ 80.1
SF3B4Q15427 TTC31-208ENST00000463189 894 ntTSL 314.92□□□□□ -0.021e-16■■■■■ 80.1
SF3B4Q15427 TTC31-210ENST00000464241 1562 ntTSL 1 (best)13.75□□□□□ -0.211e-16■■■■■ 80.1
SF3B4Q15427 TTC31-206ENST00000449459 2161 ntTSL 212.28□□□□□ -0.441e-16■■■■■ 80.1
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