Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCN1Q15293 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCN1Q15293 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCN1Q15293 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCN1Q15293 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCN1Q15293 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCN1Q15293 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCN1Q15293 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCN1Q15293 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCN1Q15293 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCN1Q15293 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCN1Q15293 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCN1Q15293 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCN1Q15293 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCN1Q15293 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCN1Q15293 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCN1Q15293 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCN1Q15293 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
RCN1Q15293 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCN1Q15293 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCN1Q15293 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCN1Q15293 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCN1Q15293 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RCN1Q15293 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RCN1Q15293 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RCN1Q15293 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCN1Q15293 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCN1Q15293 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCN1Q15293 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCN1Q15293 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCN1Q15293 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCN1Q15293 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RCN1Q15293 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCN1Q15293 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCN1Q15293 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCN1Q15293 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCN1Q15293 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCN1Q15293 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCN1Q15293 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCN1Q15293 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCN1Q15293 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCN1Q15293 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCN1Q15293 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCN1Q15293 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RCN1Q15293 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RCN1Q15293 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCN1Q15293 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCN1Q15293 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCN1Q15293 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCN1Q15293 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCN1Q15293 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCN1Q15293 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCN1Q15293 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RCN1Q15293 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RCN1Q15293 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RCN1Q15293 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RCN1Q15293 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RCN1Q15293 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RCN1Q15293 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RCN1Q15293 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RCN1Q15293 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RCN1Q15293 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RCN1Q15293 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RCN1Q15293 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RCN1Q15293 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RCN1Q15293 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RCN1Q15293 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RCN1Q15293 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RCN1Q15293 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RCN1Q15293 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RCN1Q15293 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RCN1Q15293 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCN1Q15293 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCN1Q15293 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCN1Q15293 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCN1Q15293 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCN1Q15293 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCN1Q15293 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCN1Q15293 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCN1Q15293 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCN1Q15293 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCN1Q15293 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCN1Q15293 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RCN1Q15293 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RCN1Q15293 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RCN1Q15293 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCN1Q15293 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCN1Q15293 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCN1Q15293 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCN1Q15293 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCN1Q15293 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCN1Q15293 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCN1Q15293 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCN1Q15293 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCN1Q15293 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCN1Q15293 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCN1Q15293 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCN1Q15293 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCN1Q15293 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCN1Q15293 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
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