Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCM1Q15154 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCM1Q15154 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCM1Q15154 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCM1Q15154 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCM1Q15154 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCM1Q15154 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCM1Q15154 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCM1Q15154 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCM1Q15154 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCM1Q15154 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCM1Q15154 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCM1Q15154 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCM1Q15154 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCM1Q15154 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCM1Q15154 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCM1Q15154 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCM1Q15154 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCM1Q15154 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCM1Q15154 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCM1Q15154 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCM1Q15154 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCM1Q15154 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PCM1Q15154 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCM1Q15154 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCM1Q15154 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCM1Q15154 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCM1Q15154 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCM1Q15154 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCM1Q15154 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCM1Q15154 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCM1Q15154 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCM1Q15154 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCM1Q15154 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCM1Q15154 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCM1Q15154 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCM1Q15154 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCM1Q15154 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCM1Q15154 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCM1Q15154 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCM1Q15154 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCM1Q15154 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCM1Q15154 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCM1Q15154 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCM1Q15154 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCM1Q15154 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCM1Q15154 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCM1Q15154 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCM1Q15154 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCM1Q15154 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCM1Q15154 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCM1Q15154 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCM1Q15154 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCM1Q15154 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCM1Q15154 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCM1Q15154 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCM1Q15154 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCM1Q15154 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCM1Q15154 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCM1Q15154 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCM1Q15154 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PCM1Q15154 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCM1Q15154 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCM1Q15154 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCM1Q15154 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCM1Q15154 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCM1Q15154 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCM1Q15154 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCM1Q15154 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCM1Q15154 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PCM1Q15154 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCM1Q15154 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCM1Q15154 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCM1Q15154 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCM1Q15154 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCM1Q15154 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCM1Q15154 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCM1Q15154 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCM1Q15154 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCM1Q15154 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCM1Q15154 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCM1Q15154 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCM1Q15154 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCM1Q15154 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
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