Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRD3Q15059 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRD3Q15059 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRD3Q15059 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
BRD3Q15059 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRD3Q15059 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRD3Q15059 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRD3Q15059 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRD3Q15059 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD3Q15059 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD3Q15059 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD3Q15059 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRD3Q15059 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRD3Q15059 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD3Q15059 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD3Q15059 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD3Q15059 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD3Q15059 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRD3Q15059 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRD3Q15059 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRD3Q15059 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD3Q15059 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD3Q15059 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRD3Q15059 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRD3Q15059 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRD3Q15059 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BRD3Q15059 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRD3Q15059 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD3Q15059 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD3Q15059 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD3Q15059 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD3Q15059 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD3Q15059 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD3Q15059 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRD3Q15059 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRD3Q15059 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BRD3Q15059 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRD3Q15059 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRD3Q15059 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRD3Q15059 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRD3Q15059 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRD3Q15059 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRD3Q15059 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRD3Q15059 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD3Q15059 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD3Q15059 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRD3Q15059 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD3Q15059 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD3Q15059 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD3Q15059 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD3Q15059 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms