Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRD3Q15059 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRD3Q15059 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRD3Q15059 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
BRD3Q15059 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRD3Q15059 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRD3Q15059 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRD3Q15059 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRD3Q15059 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRD3Q15059 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRD3Q15059 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRD3Q15059 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD3Q15059 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD3Q15059 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD3Q15059 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRD3Q15059 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRD3Q15059 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD3Q15059 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD3Q15059 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD3Q15059 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD3Q15059 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD3Q15059 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRD3Q15059 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRD3Q15059 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRD3Q15059 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD3Q15059 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD3Q15059 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRD3Q15059 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRD3Q15059 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRD3Q15059 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRD3Q15059 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BRD3Q15059 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRD3Q15059 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD3Q15059 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD3Q15059 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD3Q15059 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD3Q15059 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD3Q15059 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD3Q15059 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRD3Q15059 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRD3Q15059 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BRD3Q15059 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRD3Q15059 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRD3Q15059 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRD3Q15059 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRD3Q15059 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRD3Q15059 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRD3Q15059 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRD3Q15059 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD3Q15059 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD3Q15059 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRD3Q15059 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD3Q15059 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD3Q15059 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD3Q15059 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD3Q15059 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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