Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETDB1Q15047 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETDB1Q15047 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETDB1Q15047 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETDB1Q15047 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETDB1Q15047 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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SETDB1Q15047 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETDB1Q15047 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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SETDB1Q15047 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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SETDB1Q15047 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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SETDB1Q15047 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETDB1Q15047 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SETDB1Q15047 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SETDB1Q15047 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SETDB1Q15047 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SETDB1Q15047 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
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SETDB1Q15047 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETDB1Q15047 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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SETDB1Q15047 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
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SETDB1Q15047 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
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SETDB1Q15047 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETDB1Q15047 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETDB1Q15047 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
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SETDB1Q15047 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
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SETDB1Q15047 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETDB1Q15047 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
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SETDB1Q15047 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
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