Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SNX17Q15036 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SNX17Q15036 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SNX17Q15036 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SNX17Q15036 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SNX17Q15036 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SNX17Q15036 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SNX17Q15036 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SNX17Q15036 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SNX17Q15036 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SNX17Q15036 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SNX17Q15036 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SNX17Q15036 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SNX17Q15036 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SNX17Q15036 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SNX17Q15036 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SNX17Q15036 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
SNX17Q15036 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SNX17Q15036 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
SNX17Q15036 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SNX17Q15036 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
SNX17Q15036 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SNX17Q15036 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SNX17Q15036 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SNX17Q15036 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SNX17Q15036 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SNX17Q15036 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SNX17Q15036 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SNX17Q15036 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SNX17Q15036 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SNX17Q15036 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
SNX17Q15036 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SNX17Q15036 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
SNX17Q15036 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SNX17Q15036 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SNX17Q15036 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SNX17Q15036 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SNX17Q15036 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SNX17Q15036 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SNX17Q15036 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SNX17Q15036 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SNX17Q15036 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SNX17Q15036 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SNX17Q15036 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SNX17Q15036 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SNX17Q15036 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SNX17Q15036 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SNX17Q15036 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SNX17Q15036 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SNX17Q15036 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SNX17Q15036 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SNX17Q15036 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SNX17Q15036 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SNX17Q15036 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SNX17Q15036 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SNX17Q15036 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SNX17Q15036 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SNX17Q15036 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SNX17Q15036 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SNX17Q15036 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNX17Q15036 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNX17Q15036 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SNX17Q15036 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SNX17Q15036 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SNX17Q15036 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SNX17Q15036 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SNX17Q15036 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SNX17Q15036 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SNX17Q15036 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SNX17Q15036 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SNX17Q15036 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNX17Q15036 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNX17Q15036 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SNX17Q15036 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SNX17Q15036 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNX17Q15036 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNX17Q15036 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SNX17Q15036 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SNX17Q15036 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNX17Q15036 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNX17Q15036 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SNX17Q15036 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SNX17Q15036 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SNX17Q15036 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNX17Q15036 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNX17Q15036 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNX17Q15036 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNX17Q15036 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNX17Q15036 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SNX17Q15036 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNX17Q15036 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNX17Q15036 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SNX17Q15036 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNX17Q15036 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SNX17Q15036 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SNX17Q15036 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SNX17Q15036 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SNX17Q15036 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNX17Q15036 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNX17Q15036 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
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