Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
R3HDM1Q15032 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
R3HDM1Q15032 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
R3HDM1Q15032 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
R3HDM1Q15032 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
R3HDM1Q15032 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
R3HDM1Q15032 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
R3HDM1Q15032 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
R3HDM1Q15032 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
R3HDM1Q15032 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
R3HDM1Q15032 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
R3HDM1Q15032 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
R3HDM1Q15032 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
R3HDM1Q15032 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
R3HDM1Q15032 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
R3HDM1Q15032 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
R3HDM1Q15032 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
R3HDM1Q15032 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
R3HDM1Q15032 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
R3HDM1Q15032 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
R3HDM1Q15032 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
R3HDM1Q15032 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
R3HDM1Q15032 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
R3HDM1Q15032 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
R3HDM1Q15032 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
R3HDM1Q15032 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
R3HDM1Q15032 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
R3HDM1Q15032 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
R3HDM1Q15032 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
R3HDM1Q15032 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
R3HDM1Q15032 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
R3HDM1Q15032 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
R3HDM1Q15032 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
R3HDM1Q15032 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
R3HDM1Q15032 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
R3HDM1Q15032 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
R3HDM1Q15032 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
R3HDM1Q15032 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
R3HDM1Q15032 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
R3HDM1Q15032 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
R3HDM1Q15032 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
R3HDM1Q15032 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
R3HDM1Q15032 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
R3HDM1Q15032 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
R3HDM1Q15032 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
R3HDM1Q15032 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
R3HDM1Q15032 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
R3HDM1Q15032 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
R3HDM1Q15032 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
R3HDM1Q15032 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
R3HDM1Q15032 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
R3HDM1Q15032 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
R3HDM1Q15032 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
R3HDM1Q15032 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
R3HDM1Q15032 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
R3HDM1Q15032 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
R3HDM1Q15032 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
R3HDM1Q15032 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
R3HDM1Q15032 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
R3HDM1Q15032 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
R3HDM1Q15032 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
R3HDM1Q15032 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
R3HDM1Q15032 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
R3HDM1Q15032 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
R3HDM1Q15032 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
R3HDM1Q15032 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
R3HDM1Q15032 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
R3HDM1Q15032 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
R3HDM1Q15032 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
R3HDM1Q15032 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
R3HDM1Q15032 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
R3HDM1Q15032 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
R3HDM1Q15032 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
R3HDM1Q15032 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
R3HDM1Q15032 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
R3HDM1Q15032 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
R3HDM1Q15032 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
R3HDM1Q15032 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
R3HDM1Q15032 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
R3HDM1Q15032 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
R3HDM1Q15032 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
R3HDM1Q15032 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
R3HDM1Q15032 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
R3HDM1Q15032 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
R3HDM1Q15032 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
R3HDM1Q15032 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
R3HDM1Q15032 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
R3HDM1Q15032 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
R3HDM1Q15032 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
R3HDM1Q15032 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
R3HDM1Q15032 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
R3HDM1Q15032 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
R3HDM1Q15032 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
R3HDM1Q15032 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
R3HDM1Q15032 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
R3HDM1Q15032 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
R3HDM1Q15032 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
R3HDM1Q15032 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
R3HDM1Q15032 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
R3HDM1Q15032 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
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