Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERPUD1Q15011 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD1Q15011 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD1Q15011 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERPUD1Q15011 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERPUD1Q15011 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERPUD1Q15011 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERPUD1Q15011 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERPUD1Q15011 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERPUD1Q15011 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERPUD1Q15011 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERPUD1Q15011 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERPUD1Q15011 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERPUD1Q15011 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERPUD1Q15011 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERPUD1Q15011 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERPUD1Q15011 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERPUD1Q15011 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERPUD1Q15011 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERPUD1Q15011 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERPUD1Q15011 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERPUD1Q15011 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERPUD1Q15011 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERPUD1Q15011 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERPUD1Q15011 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERPUD1Q15011 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERPUD1Q15011 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD1Q15011 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HERPUD1Q15011 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD1Q15011 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD1Q15011 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD1Q15011 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD1Q15011 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD1Q15011 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD1Q15011 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD1Q15011 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD1Q15011 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERPUD1Q15011 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD1Q15011 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD1Q15011 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD1Q15011 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD1Q15011 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERPUD1Q15011 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERPUD1Q15011 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERPUD1Q15011 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERPUD1Q15011 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERPUD1Q15011 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERPUD1Q15011 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERPUD1Q15011 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERPUD1Q15011 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERPUD1Q15011 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERPUD1Q15011 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERPUD1Q15011 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HERPUD1Q15011 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERPUD1Q15011 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HERPUD1Q15011 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HERPUD1Q15011 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERPUD1Q15011 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERPUD1Q15011 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERPUD1Q15011 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERPUD1Q15011 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERPUD1Q15011 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERPUD1Q15011 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERPUD1Q15011 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERPUD1Q15011 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERPUD1Q15011 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERPUD1Q15011 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERPUD1Q15011 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERPUD1Q15011 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERPUD1Q15011 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERPUD1Q15011 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERPUD1Q15011 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERPUD1Q15011 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERPUD1Q15011 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERPUD1Q15011 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERPUD1Q15011 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERPUD1Q15011 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERPUD1Q15011 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERPUD1Q15011 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERPUD1Q15011 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERPUD1Q15011 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERPUD1Q15011 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERPUD1Q15011 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERPUD1Q15011 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERPUD1Q15011 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERPUD1Q15011 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERPUD1Q15011 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HERPUD1Q15011 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERPUD1Q15011 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERPUD1Q15011 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERPUD1Q15011 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERPUD1Q15011 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD1Q15011 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD1Q15011 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERPUD1Q15011 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERPUD1Q15011 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERPUD1Q15011 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERPUD1Q15011 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HERPUD1Q15011 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERPUD1Q15011 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
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