Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2CQ14957 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2CQ14957 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2CQ14957 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GRIN2CQ14957 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2CQ14957 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2CQ14957 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2CQ14957 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2CQ14957 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2CQ14957 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2CQ14957 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2CQ14957 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2CQ14957 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2CQ14957 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIN2CQ14957 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2CQ14957 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2CQ14957 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2CQ14957 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2CQ14957 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2CQ14957 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2CQ14957 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2CQ14957 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2CQ14957 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2CQ14957 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2CQ14957 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2CQ14957 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2CQ14957 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2CQ14957 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2CQ14957 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2CQ14957 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2CQ14957 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2CQ14957 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2CQ14957 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2CQ14957 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2CQ14957 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2CQ14957 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2CQ14957 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN2CQ14957 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN2CQ14957 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN2CQ14957 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2CQ14957 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2CQ14957 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2CQ14957 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2CQ14957 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2CQ14957 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2CQ14957 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2CQ14957 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIN2CQ14957 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2CQ14957 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2CQ14957 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2CQ14957 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2CQ14957 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2CQ14957 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2CQ14957 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2CQ14957 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2CQ14957 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2CQ14957 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2CQ14957 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2CQ14957 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2CQ14957 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2CQ14957 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2CQ14957 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2CQ14957 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2CQ14957 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2CQ14957 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2CQ14957 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2CQ14957 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2CQ14957 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2CQ14957 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2CQ14957 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2CQ14957 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2CQ14957 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2CQ14957 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2CQ14957 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2CQ14957 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2CQ14957 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2CQ14957 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2CQ14957 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2CQ14957 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2CQ14957 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2CQ14957 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2CQ14957 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2CQ14957 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GRIN2CQ14957 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2CQ14957 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2CQ14957 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIN2CQ14957 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIN2CQ14957 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2CQ14957 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GRIN2CQ14957 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2CQ14957 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2CQ14957 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2CQ14957 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2CQ14957 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2CQ14957 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2CQ14957 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2CQ14957 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2CQ14957 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2CQ14957 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2CQ14957 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
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