Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CHD4Q14839 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CHD4Q14839 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CHD4Q14839 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
CHD4Q14839 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CHD4Q14839 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHD4Q14839 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHD4Q14839 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHD4Q14839 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHD4Q14839 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHD4Q14839 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHD4Q14839 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHD4Q14839 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHD4Q14839 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHD4Q14839 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CHD4Q14839 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHD4Q14839 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CHD4Q14839 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CHD4Q14839 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHD4Q14839 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHD4Q14839 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHD4Q14839 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHD4Q14839 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHD4Q14839 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CHD4Q14839 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHD4Q14839 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CHD4Q14839 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CHD4Q14839 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CHD4Q14839 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CHD4Q14839 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CHD4Q14839 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CHD4Q14839 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHD4Q14839 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHD4Q14839 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CHD4Q14839 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHD4Q14839 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHD4Q14839 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHD4Q14839 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHD4Q14839 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHD4Q14839 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHD4Q14839 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHD4Q14839 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHD4Q14839 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHD4Q14839 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHD4Q14839 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHD4Q14839 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CHD4Q14839 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHD4Q14839 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHD4Q14839 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CHD4Q14839 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHD4Q14839 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CHD4Q14839 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CHD4Q14839 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CHD4Q14839 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CHD4Q14839 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHD4Q14839 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHD4Q14839 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHD4Q14839 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHD4Q14839 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHD4Q14839 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHD4Q14839 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHD4Q14839 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHD4Q14839 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CHD4Q14839 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHD4Q14839 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHD4Q14839 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHD4Q14839 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHD4Q14839 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CHD4Q14839 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CHD4Q14839 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHD4Q14839 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHD4Q14839 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CHD4Q14839 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHD4Q14839 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHD4Q14839 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHD4Q14839 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35■■■■□ 3.19
CHD4Q14839 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHD4Q14839 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHD4Q14839 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHD4Q14839 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CHD4Q14839 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHD4Q14839 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHD4Q14839 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHD4Q14839 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHD4Q14839 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHD4Q14839 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CHD4Q14839 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHD4Q14839 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHD4Q14839 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHD4Q14839 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHD4Q14839 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHD4Q14839 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHD4Q14839 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHD4Q14839 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHD4Q14839 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHD4Q14839 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHD4Q14839 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHD4Q14839 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHD4Q14839 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CHD4Q14839 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms