Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SCN5AQ14524 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCN5AQ14524 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCN5AQ14524 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN5AQ14524 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN5AQ14524 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN5AQ14524 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCN5AQ14524 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN5AQ14524 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCN5AQ14524 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCN5AQ14524 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN5AQ14524 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCN5AQ14524 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCN5AQ14524 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN5AQ14524 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN5AQ14524 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN5AQ14524 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN5AQ14524 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCN5AQ14524 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCN5AQ14524 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCN5AQ14524 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCN5AQ14524 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SCN5AQ14524 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCN5AQ14524 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN5AQ14524 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN5AQ14524 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN5AQ14524 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN5AQ14524 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN5AQ14524 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN5AQ14524 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN5AQ14524 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN5AQ14524 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN5AQ14524 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN5AQ14524 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCN5AQ14524 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCN5AQ14524 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCN5AQ14524 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCN5AQ14524 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCN5AQ14524 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCN5AQ14524 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCN5AQ14524 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCN5AQ14524 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCN5AQ14524 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCN5AQ14524 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCN5AQ14524 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCN5AQ14524 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCN5AQ14524 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCN5AQ14524 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN5AQ14524 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
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